高级生物化学专题二模拟酶
专题之二模拟酶的基础知识及进展;2, 酶的促作用机理;二,对酶活性中心功能团的模拟;;酶催化中心的组成;胰凝蛋白酶对肽键的水解机理(第一步);胰凝蛋白酶的水解机理(第二步);胰凝蛋白酶的水解机理(第三步);酶高效催化的机理及实例;一.决定酶高效催化的机理;1.底物和酶的靠近(proximity)与定向(orientation)
在化学反应中,反应速度与反应物的浓度成正比,若在酶促反应系统中的催化场所—酶的活性中心,增加底物浓度,反应速度也会随之增加。
酶促反应加速的原因之一,就是使底物分子集中于酶的活性中心,大大提高这个区域底物的有效浓度,从而加速酶促反应速度。
曾测过某酶促反应中,溶液中的底物浓度为0.001mol/L,而在活性中心的底物浓度竟达到10mol/L,比溶液中高出一万倍!因此在酶活性中心区域的高底物浓度决定了高的反应速度。; 仅仅是靠??还不够,还需要酶和底物的反应基团在反应中彼此相互严格地定向,即酶活性中心的催化基团(氨基酸残基上的基团)定向于底物的反应基团。只有既靠近又定向,底物分子才能迅速的形成过渡态,加速反应的进行。; 2.底物变形(distortion)与电子张力(electron strain)
酶与底物结合后,底物发生变形,底物由基态变为激发态,降低了活化能,使酶促反应加速。 ;3.共价催化(cov
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