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2009, 32 ( 4): 2832
J ournal of N anj ing A g ricultural Un iv er sity http: / /nauxbnjaueducn
, , , . SSR [ J]. , 2009, 32( 4) : 2832
SSR
1, 3 2 3 1 1 1*
, , , , ,
( 1. , 21009 ; 2. , 21 008;
3. , 201106)
: Perl SSR SSRFinder, ( Genoscope)
( V it is v infi era L. ) PN40024 114 20 SSR
SSR 37 648 ( 329% )30 123 ( 263% )
18 70 ( 163% )14 66 ( 127% )3 492 ( 30% ) 9 986 ( 87% ) SSR ,
, A /T SSR, C/G SSRSSR
, , SSR
SSR SSR 80 06 ( 699% ) SSR,
W eb SSR DGSSR, EST SSR, , http: / /
wwwyaolabshcn/ssr
: SSR; ; ;
: S6631 : A : (2009) 0400280
Analysis of SSRs in grape genome and development of SSR database
1, 3 2 3 1 1 1*
CA IB in , LI Chenghu i, YAO Quanhong , ZHOU Jun , TAO Jianm in , ZHANG Zhen
( 1. College ofH orticu lture, Nanjing Agricu lturalUn iversity, Nanjing 21009 , China;
2. Suzhou Polytechn ic Institute of Agriculture, Suzhou 21 008, China;
3. B iotechnology Research Institute of Shanghai Academ y of Agricu ltural Sciences, Shanghai 201106, China)
Abstract: W e developed a Perl scriptSSRFinder to detect SSRs in grape genom e sequence. A total of 114 20 SSRsw ere isolated
from publicly availab le V it is v infi era L. P inorNoriPN40024 genom icDNA sequence. Among them, 37 648m ononucleotide re
peats, 30 123 d inucleotide repeats, 18 70 trinucleotide repeats, 14 66 tetranu
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