5 2 基因转录及加工.pptVIP

真核生物基因转录 Roger D. Kornberg was awarded the 2006 Nobel Prize in Chemistry for his studies of the molecular basis of eukaryotic transcription. 真核生物基因转录应用 真核生物基因转录特点： 1.转录启动子结构复杂，不同类型的RNA有不同的启动序列； 2.多种RNA聚合酶转录不同的RNA产物； 3.多个调节因子参与转录调节； 4.转录和翻译在时间和空间上分隔，转录后存在广泛的加工。 基因调控区：由三部分组成 核心元件区：——决定是否转录 由TATAbox和起始位点（TSS）组成 上游调控区UPE (Upstream Promoter Element) ： 具多种调控元件 CAAT框、GC框等，含其中一种或多种，决定转录强弱（转录活化和转录起始频率），启动子的强弱取决于UPE的类型。 远端调控区： 位于转录起始位点更上游；如β –珠蛋白基因的远端调控区在-1300 — -3300间 增强子：使与它连锁的基因转录频率明显增强的DNA序列，作为基因表达的重要调节元件。 特点： 1.增强效应明显（10 – 200倍）； 2.增强效应与其位置和取向无关； 3.大多为重复序列，一般50bp； 4.增强效应有严密的组织和细胞特异性，只有特定的蛋白质（转录因子）参与才能发挥其功能； 5. 没有基因专一性。 作用机制：通过改变模板DNA的整体结构（影响DNA-Pro复合物的结构或改变DNA超螺旋密度） eg.形成Z-DNA，增强子才有功能。 一个增强子并不限于促进某一特殊启动子的转录，它能刺激附近的任一启动子。Gene clone HACNS1增强子 HACNS1（又叫CENTG2）是对进化有贡献的一个基因增强子。 如今有证据显示在人类基因组发现的十一万基因增强子中HACNS1在人类与祖先黑猩猩分道扬镳之后的进化过程中变化最大，对人手指和可能改造脚踝以适应人类两腿行走意义 。 真核基因表达调控 甲基化预测 在我们的基因组中，发生甲基化的DNA影响基因的开关。基因表达能够推断与我们的身份相关联的几种属性，如性别、种族、年龄和健康，甚至童年时代经历。 Factors underlying variable DNA methylation in a human community cohort. Lucia L. Lama, et al. doi: 10.1073/pnas.1121249109 真核基因转录后的加工 1.真核基因转录产物的特点： 含内含子，需经剪接去除； 需要修饰（加帽、加尾，稀有碱基）； 转录和翻译是两个相对独立的过程。 2.加工类型: 加帽、加尾 修饰——甲基化、酰基化 剪接 RNA编辑 RNA加工的意义： 活化——使无活性的前体RNA加工成有活性的成熟RNA；（rRNA、tRNA的剪接、修饰） 改变基因的编码产物——同一转录产物，不同剪接方式，编辑方式，蛋白产物不同； 调节方式——加工会影响RNA的活性、半衰期、运输等，影响RNA功能的发挥； 编码蛋白质的结构基因在核浆中被转录，RNA分子很大，且很不稳定，由于大小很不一致，称为核内不均一RNA（hnRNA），其中mRNA是由hnRNA加工成的。 hnRNA 25%——mRNA 75%——在核内降解 hnRNA先加帽， hnRNA尾端被切去一段后，加poly（A）尾，切除内含子成为mRNA，进入细胞浆内。 加帽 ( Cap0、CapI、CapII三种帽子结构 ) 在细胞核中进行，hnRNA的5’端常为GTP， 帽子化过程后，形成m7G5’ppp5’Np结构。 5’帽子的功能： 保护mRNA免受5’-核酸外切酶降解； 使mRNA进入细胞质； 对翻译起识别作用（ m7G5’ppp5’Np 优先与 核糖体结合）。 RNA splicing and editing 剪接splicing —— 把断裂基因转录本中的内含子除去真核生物基因是断裂基因(split gene) 外显子(exon)与内含子(intron) 内含子的剪接方式 自我剪接（由RNA分子本身完成 ）：Ⅰ型 Ⅱ型 剪接体SnRNP参与——mRNA 酶蛋白参与的剪接—