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FST 实例介绍 FST 是种群分化和遗传距离的一种衡量方法。下面通过两个例子来理解 FST，并对本文 中FST 公式做数学意义上的推导和解释。 一、实例分析 1、概念定义 首先定义杂合性 （杂合子的概率）的两个不同层次的衡量方法： HT：expected heterozygosity in random mating total population 种群自由交配情况下的杂合性= HS：mean expected heterozygosity within random mating subpopulations 亚群内自由交配情况下的平均杂合性=2p q i i 那么固定系数就为： HT −HS HS FST = = 1 − HT HT 其中： HT = 2 p q m 1 1 HS = HS = (HS1 + HS2 + ⋯+ HSm) = 2p q i i m m i=1 进而可得： 1 HS m 2p q i =1 i i m FST = 1 − = 1 − HT 2 p q 2、老鼠的例子 由于中间区域猫的存在，老鼠的种群被分割成两个亚群，亚群间无基因交流，经过一段 时间，东部的西部的老鼠已经分别纯化。这时种群的固定系数为1。 计算过程：（假定现在种群中基因A 出现的频率为 p ，那么a 出现的频率为 q = 1 −p ） 假定西部亚群大小为N1，东部种群大小为N2，N1+N2=N，那么 （分别以p 和q 表示种群或亚群中基因A 和a 出现的频率） N1 p1 = p A = = 1，q1 = 1 −p1 = 0； N1 0 p2 = p A = = 0，q2 = 1 −p2 = 1； N2 N1 N1