第01篇 基因组.pdf

第1章 基因组 1) 遗传的分子基础 2) 基因组顺序复杂性 3) 基因与基因家族 4) 基因组 遗传的分子基础 1) DNA的化学与生物学 2) RNA 的化学与生物学 3) 蛋白质的结构与生物学 遗传信息流—中心法则 四种核苷酸 DNA的结构特点 1）DNA 由两条具有极性的互补单链组成. 2) 两条互补单链走向相反. 3) DNA双螺旋大小沟槽交替排列. 4 ）碱基配对原则：A-T，C-G，A-T配对形成 2对氢键，C- G配对形成3对氢键. 5 ）每旋转一圈为10.5 bp (碱基对) . 核苷酸的化学极性与生物学 1) DNA的合成具有方向性, 造成先行链 与延滞链复制方式的差异; 2) DNA的降解具有方向性, 3’→5’ 和 5’→3’ 的降解由不同的酶执行; 3) 遗传密码的编排具有方向性, 只有正 链才具有编码功能; 4) 导致转录的方向性. DNA双螺旋的生物学 1) DNA的双螺旋使DNA 的复制复杂化, 必需一套解旋机制; 2) DNA双螺旋的大小沟具有结构信息, 许多蛋白质都与大沟结合; 3) DNA双螺旋产生了环状DNA分子的拓 扑学结构的变化. 4) DNA双螺旋的螺距约10 bp, 转录因子的 结合与此有关. DNA 双 螺 旋 DNA 大 小 沟 的 结 构 信 息 DNA 双 螺 旋 拓 扑 学 结 构 碱基配对的生物学 1) 遗传信息的忠实传递. 2) 每一种核苷酸都有二种互变异构体（tautomer ），它们 处在动态平衡中。例如胸腺嘧啶有二种异构体，即酮式 （keto ）和烯醇式（enol ）胸腺嘧啶。就每个分子而言 偶然会从一种异构体转为另一种异构体，胸腺嘧啶的情 况是趋向于酮式异构体。如果复制叉经过某一胸腺嘧啶 碱基，而后者又恰恰处在烯醇式异构体时，就会发生一 次错配。因为烯醇式胸腺嘧啶更趋向于与G而不是与A 配对。稀有的亚氨基腺嘌呤异构体优先与C而非与T配 对，烯醇鸟嘌呤异构体优先与胸腺嘧啶配对。 3) A-T键能小于G-C键能, A/T顺序更易解链, 因此在需要快 速解链的区域A/T碱基对比例较高,如启动子区. 碱基错配的原因 螺距长为10碱基对 每一轮双螺旋由10碱基对组成, 这一结构具 有多种生物学意义: 1) 启动子与转录起始点位置; 2) 转录因子与DNA结合的位置; 3) 引起DNA弯曲A/T碱基对的平面有点 倾斜, G/C较平整. 在周期性重复的 (A/T)5-6与(G/C)4-6序列, DNA分子会发 生弯曲. 弯曲DNA在基因表达调控中具 有重要意义. 4) 缠绕在核小体上的DNA碱基对的朝向. RNA的结构与生物学 1) 2’—OH赋予了RNA许多不同与DNA 的特性, 极易断裂与分解,不能形成稳定的双螺旋; 2) 单链RNA分子的链内配对可形成高级结构, 赋 予RNA分子在生命活动中担负许多重要的结构 和催化功能; 3) RNA 的核苷酸组成中由尿嘧啶取代了DNA 中 的胞嘧啶, 使其不能成为遗传信息的载体. RNA核苷酸单体都有2’—OH