分子动力学软件GROMACS在GPUK20上的测试.pdfVIP

64 《高性能计算发展与应用》 2013年第二期 总第四十三期 分子动力学软件GROMACS在GPU K20上的测试  寇大治 上海超级计算中心 上海201203 dzkou@ssc.net.cn 摘要: [1-3] NVIDIA公司推出了其新一代的Tesla GPU产品K20，同时Gromacs软件也推出了全新的直 接支持GPU CUDA计算的版本4.6系列，本文基于K20平台使用Gromacs 4.6.1做了一些应用测 试，并做了相应的比较和分析。 1.简介 针对分子动力学计算的性能尤其是GPU的性能影响已 [4-6] 分子动