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拷贝数变异与基因诊断.pdf

( ) 53 《中国产前诊断杂志 电子版 》 2008 年第 1 卷第 1 期    ·综述 · 拷贝数变异与基因诊断 邢清和  贺林 (复旦大学生物医学研究院 , 上海  200032) 【摘要】  基因诊断依赖于有效的遗传标记 ,但多数遗传病的发病机制尚不清楚 ,也缺乏有效的分子标 记 ,本文介绍了拷贝数变异有可能成为寻找遗传病致病基因的新途径 ,为基因诊断和产前诊断提供有力 的支持 。 【关键词】 拷贝数变异 ; 基因诊断 ; 产前诊断   多数遗传病不能治愈 ,对遗传疾病进行基因诊断 ,可以 number variable region s , CN V R s) ,涵盖 360 Mb , 为疾病确诊 、早防早治提供帮助 ;进行产前诊断 ,为有关家庭 约占人类基因组全长的 12 % ,不同染色体间所 占比 提供遗传咨询 ,可以有效避免患儿的出生 , 防患于未然 。基 例从 6 %到 19 %不等 。CN V s 在基因组中不是随机 因诊断依赖于有效的遗传标记 ,但是多数遗传病的发病机制 分布的 ,存在一些 CN V s 分布的“HO T ”和“COL D ” 尚不清楚 ,也缺乏有效的分子标记 。据统计 ,到 2008 年 3 月 [3 ] 区域 ,其中 ,58 %的 CN V R s 与已知基因序列部分 27 日止 ,OM IM (online mendelian inherit ance in men) 数据库 重叠 ,超过 99 % 的 CN V R s 与保守的非编码序列部 收录的遗传性疾病有 5 981 种 ,其中 3 70 1 种致病基因和发 分重叠[4 ] ,片段长度小于 20 kb 的 CN V s 比大于 20 病机制不明 ,这给基因诊断和产前诊断造成了很大的困难 。 kb 的更为多见 。保守估计 ,不同个体间 CN V s 的差 ( ) 拷贝数变异 Cop y number variation ,CN V 是一种重要的结 ( ) 异可达 4Mb ( 1/ 800bp ) [ 5 ] ,不太保守的认为在 5~24 构变异 St ruct ural variant ,它有重要的功能 ,与不少遗传病 有关 ,CN V s 的研究正在崭露头角 ,很有可能成为寻找遗传 Mb 之间[ 6 ] ,而 SN P s 的差异仅有2 . 5 Mb ( 1/ 1 200 病致病基因的新途径 ,并为基因诊断和产前诊断提供有力支 bp ) [ 7 ] 。因此 ,不管何种算法 ,个体间 CN V s 的差异 撑 。 都远大于 SN P s 。 ( 随着比较基因组杂交芯片 array of

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