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l生冒麴堑遗盏直弛妾塞进展
利用微卫星标记对蒙古马和纯血马遗传多样性的研究
李金莲石有斐菩 未
(内蒙古农业大学动物科学与医学学院,呼和浩特,010018)
摘要本文通过13个微卫星位点对蒙古马和纯血马两大品种的60匹马进行了遗传检测。用
8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,并用银染法显色。通过软件计算了13个微卫星座
位的等位基因频率、有效等位基因数、多态信息含量和杂合度。结果是13个位点中UCDEQ440变异最
大.TKYl6变异最小;纯血马各项指标的平均值均稍高于蒙古马;总群体的平均遗传分化系数是
0.0429,即品种闻变异占总群体变异的4.29%。这些研究将为今后我国培育优良品种提供思路。
关键词蒙古马;纯血马;微卫星;遗传多样性
(simplesequence
翼序列构成了微卫星位点。微卫星具有数量多,分布广,多态性丰富,呈共显性遗传以及检测快速方便
等优点丽倍受生物技术领域的欢迎。现在微卫星技术在许多家畜上应用很多,但在马上应用较少,特别
是在蒙古马和纯血马的遗传多样性研究方面,国内外还未见报道。场地速度赛马业目前在我国来讲还
处于起步阶段,由于蒙古马是我国优良的地方品种,是我国独特的马遗传资源,具有抗病性强、耐力好和
易合群等特点;纯血马是引进品种,具有体格高大、健壮和速度快等优点。因此,本文旨在通过13个微
卫星位点来分析这两大品种的遗传多样性,为今后我国场地速度赛马业的发展提供理论依据。
1材料与方法
1.1 样本的采集和基因组DNA的提取
采自内蒙古自治区赛马场马术队,均用ACD抗凝,一70℃保存。
基因组DNA的提取具体方法参考《分子克隆实验指南》…。
1.2 PCR引物的选择庞PCR反应条件的确定
百盛公司合成的13对微卫星引物序列见表1。
裹1 13对微卫星引物序列
屋鱼动堑金王遗僮燕盎塑左逵lI267
本实验所采用的ExTaq
检测。
1.3凝胶电泳及微卫星基因型判定
PCR扩增反应结束后,用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,并用硝酸银染色法
显色。以pUCl9 PhotoMW
软件判定各微卫星位点的基因型。
1.4统计指标
informationcon.
计算微卫星位点的等位基因频率(allelefrequency)、多态信息含量(polymorphism
numberof
诎她,PIC)、有效等位基因数(effective
of
(coefficientdifferentiation,Gsr)。
gene
2结果与分析
2.1基因组DNA提取
从冻血中提取的基因组DNA用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,然后在紫外灯下观察,结果见图1。
圈1基因组DNA琼脂糖凝胶电泳检测结果
2.2微卫星DNA的PCR扩增
扩增产物的银染结果。在此只列出其中的一个位点UM002的电泳结果(见图2)。其中,l一7为蒙古马
样品;1’~7’为纯血马样品;M为pUCl9DNA/MspI(HpaII)Marker。
圈2 UM002位点在孽古马和纯血马中的部分扩增结果
2.3微卫星DNA的多态性
2.3.1蒙古马和纯血马两个品种内的遗传变异
根据相应公式计算,以两个品种中的不同个体在每个位点上所检测到的等位基因及根据GENGPOP
软件所得出的等位基因频率(此表略)以及P1C和GDA软件为基础,得到群体内的有效等位基因数、多
态信息含量和杂合度,结果见表2。就各位点来说,UCDEQ440的有效等位基因数、多态信息含量、群体
杂合度这3项数据在两个品种马中都是最高,而TKYl6的3项数据却是最低,说明在13个位点中UC.
DEQ440变异最大,TKYl6变异最小;从品种来看,纯血马的各项指标均高于蒙古马,由此说明蒙古马相
对纯血马来说更纯一甚。
268_I生国劲塑遗传直弛班宜进
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