16SrRNA应用复兴.pptVIP

16SrRNA应用的复兴;摘要;16srRNA及元基因组法的对比;16srRNA具有不寻常的特征 特征 普遍存在性，末端序列守恒，具有一个进化速率变化的区结构。 在微生物进化和生态学研究中的作用地位： 第一，完全改变了进化的观点。 提供一个客观的系统发生的框架，并在这个框架中分类细胞生物等级。 第二，通过对直接来自环境中的16srRNA的克隆和测序，证明了微生物的差异远比我们以前基于培养研究的差异要广泛的多。;元基因组是对一个群落的功能研究： 使用高通量的鸟枪法测序 优点： 随机抽样存在于一个栖息地的所有基因而不只是16srRNA ，因而提供了对一个群落的功能研究，而不只是对它的种系发育的总结。 ;结论： 第一步：应用经典的16srRNA对群落成分进行描述（在很大程度上决定了将要使用的测序技术及序列必需的数量 ） 第二步：元基因组分析 ;;数据产生;数据产生;数据产生;; 分析工具 ;OTU 应用数学方法和电子计算机来研究生物分类问题的边缘学科。又称数值分类学。数值分类学的工作方法大致分为5步。①选择所要研究的单位（如品系或种等），所用最低级的实体称为操作分类单位（OTU＝Operational Taxonomic Unit）。②选择OTU的性状（ 包括形态学、细胞学、古生物学