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乳糖酶基因的克隆及生物信息学分析【摘要】? 目的:克隆并分析保加利亚德氏乳杆菌中的乳糖酶基因。方法:利用PCR技术从保加利亚德氏乳杆菌中克隆出乳糖酶基因、测序并生物信息学分析。结果:成功的从保加利亚德氏乳杆菌中克隆出全长为3 024 bp的乳糖酶基因,利用生物软件分析,推测乳糖酶基因共编码1 008个氨基酸,蛋白分子量为114 KDa,等电点为4.9,氨基酸序列中共有9处潜在的糖基化位点。并将此基因与不同来源的乳糖酶基因进行同源性比较。结论:成功的克隆出乳糖酶基因,并利用生物分析软件对其进行生物信息学分析。了解该酶的性质特征,为进一步研究及低成本表达该酶奠定基础。
【关键词】? 乳糖酶基因;克隆;生物信息学分析
Clone and bioinformatics analysis of lactase gene
??? WANG? Zheng1, 2, MA? Wenli1, ZHENG? Wenling1
??? (1.Institute of Gene Project, South Medical University? Guangzhou? 510510, China; 2.Key Laboratory of Molecular Biology, Hainan Medical College? Haikou 571101, China )
??? [ABSTRACT] Objective: To clone and analyze lactase gene from Lactobacillus delbrueckii bulgaricus. Methods: Cloned lactase gene from Lactobacillus delbrueckii bulgaricus with PCR, made sequencing and bioinformatics analysis. Results: Cloned lactase gene (3 024 bp) successfully. It was presumed that the lactase gene encode 1 008 amino acids, with protein molecule 114 KDa, isoelectric point 4.9, 9 potential glycosylation sites in amino acid sequence. Made homology comparison with other lacteses. Conclusion: The lactase gene is cloned successfully and the bioinformatics analysis is made by biological analysis software to investigate its character. It provides foundation for further study and colonization at low cost.
??? [KEY WORDS] Lactase gene; Clone; Bioinformatics analysis
??? 乳及乳制品含有丰富的优质蛋白质、脂肪、碳水化合物以及几乎全部已知的维生素和多种矿物质,还含有免疫球蛋白等抗病因子,易被人体消化吸收,是人类改善营养、增强体质的理想食品[1]。除此之外,在牛乳等制品当中还含有5%左右的乳糖,它是牛奶中主要的碳水化合物,对人体有着重要的作用。主要表现在于乳糖能促进钙质吸收及整理肠道的功效,特别是乳糖被分解后的半乳糖是婴儿脑发育的必需物质,与婴儿大脑的迅速成长有密切关系。然而,人体却不能直接利用乳糖,它必须被乳糖酶分解为单糖的葡萄糖及半乳糖后才能被吸收和利用。据研究发现,世界各国人口都有不同程度的乳糖酶缺乏,东方人乳糖酶缺乏高达85%[2],从而导致“乳糖不耐症”的发生。
??? 乳糖酶(EC3.2.1.23,又名β半乳糖苷酶)能将牛乳中的乳糖水解为葡萄糖和半乳糖,并具有半乳糖苷的转移作用[3]。利用该酶生产低乳糖制品或口服酶制剂,能够有效解决“乳糖不耐症”问题。乳糖酶广泛存在于扁桃、桃、杏、苹果和咖啡豆等植物中,大肠杆菌、乳酸杆菌、酵母菌和霉菌等微生物中,以及有效哺乳动物的小肠等器官和皮肤组织中。然而,不同来源的乳糖酶,其酶学性质相差很大。本研究从保加利亚德氏乳杆菌中成功的克隆出乳糖酶基因,并利用生物分析软件对其进行生物信息学分析。了解该酶的性质特征,为进一步研究及低成本表达该酶奠定基础。
??? 1? 材料与方法
??? 1.1? 材料
??? 1.1.1? 菌株与质粒? 保加利亚德氏乳杆菌购
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