第5章蛋白质翻译研讨.ppt

第五章 蛋 白 质 翻 译 ;5.1. 基本概念 ;5.1.基 本 概 念;● the second step of gene expression;● codon： universal triplex codon 三联体密码子;5.2. 基 本 元 件;;5.1.1. tRNA;---aa 接受臂 ; loading aa at 3’ end;;● tRNA的”L”三维结构与功能;;---“L”结构中碱基堆积力大 使其拓扑结构趋于稳定 --- wobble base （摇摆碱基） 位于“L”结构末端 堆积力小 自由度大 使碱基配对摇摆;“L”结构域的功能; have GC content of 60% Rich methylation each cell contains from several hundred to over 20,000 copies of rDNA gene rRNA synthesized in nucleolus;● Prokaryote 23S, 16S, 5S / Eukaryote 28S-5.8S, 18S, 5S;;● In Prok.;In Euk.;● 23s rRNA;mRNA具有两个必需的特征： 可翻译的密码序列（开放阅读框架，ORF） 核糖体结合位点（RBS） ;● In Prokaryote;;● In Eukaryote;5.3. Genetic Code;5.3.1. Universal triplet codon;Marshall Nirenberg (1961);M. Nirenberg P. Leder (1964. Science 145;1399);Ser-C14…. ;61个codons被破译，仅剩UAA,UAG,UGA (Stop codon).;Genetic codon字典;5.3.2. Degeneracy of codon (密码子的简并现象);密码子的简并性;b) 简并现象的机理；;● Wobble base的摇摆配对原则;由于变偶性的存在，细胞内只需要32种tRNA就可以识别61个编码氨基酸的密码子。;● Wobble base摇摆配对的机理;5.3.3. codon usage (codon bias);Codon usage Observed for E.coli Ribosome Protein;Codon usage in the genes of Animals;　（1）codon usage ~ 正相关 ~ tRNA abundance ;23 / 1209 10 / 1209 13 / 1209 3 / 1209;5.3.4. 遗传密码的变异性;Codons Comparing between in usual and in mt;● Codon-reading;● Codon-reading;5.3.5 codon in codon or general genetic codon (广义密码);a) codon / anti-codon间的缔合能分析;b) codon对氨基酸性质的决定;Codon in codon (依 2edNt of codon预测氨基酸的性质);UCN 中 GCN 中 GAU/C 中 UGG GGN AAU/C UAU/C ACN GAA/G CAA/G UCN CAA/G AAA/G CCN AAA/G AAU/C CGN AUG GAA/G AAU/C CAU/C CAU/G CAA/G UUU/C GAU/C 亲 GAA/G