结构生物学9.ppt

第四章 核酸的结构原理（教材第9章） 核酸包括核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）两大类，它们对生物体的遗传信息的传递、蛋白质的生物合成及生物的发育调控等生命过程起着决定性的作用。 核酸的结构与功能 染色体的结构 基因组 核酸的结构与功能 核酸结构的研究简史 核酸的基本结构单位 DNA的结构 DNA的功能 RNA的结构 RNA的功能 核酸结构的研究简史 1868年，瑞士的Friedrich Miescher从脓细胞核中提取得到结合蛋白质的核酸，称为核素（nuclein） 1889年，Richard Altmann得到不含蛋白质的核素，命名为核酸（nucleic acid） 1929年，Levene Jacobs得到核酸的化学组成 1938年，Astbury开始DNA纤维衍射的工作 1944年，Avery等完成肺炎球菌转化试验，证明DNA是遗传物质 1950年前后，Chargaff和Markham分析了各种生物DNA的碱基组成，发现了DNA碱基组成规律：A=T, G=C 1953年，James Watson和Francis Crick建立DNA双螺旋结构模型 核酸结构的研究简史（续） 1970s年代初，建立DNA重组技术，产生了一门新的学科——基因工程。 1970s年代末，开始进行人工合成DNA片段的结晶和晶体衍射的分析工作。 1978年发表了第一个DNA片段晶体结构，是一个四核苷酸片段。 1979年，A.Rich测定了d(CGCGCG)片段的晶体结构，发现是一个左手双螺旋结构。 1980年，R.E.Dickerson测定了12聚核苷酸片段：d(CGCGAATTCGCG)的晶体结构，证实了Watson-Crick模型的正确性，同时也发现了一些不同的结构特征。 1992年，建立了核酸三维结构数据库NDB。 现在，X射线晶体学、NMR和计算机模拟方法都已经用于研究核酸的空间结构。 核酸的基本结构单位 核酸是线性的多聚核苷酸（polynucleotide），核苷酸（nucleotide）是核酸的基本结构单位 核苷酸的结构 核苷 戊糖 碱基 磷酸 戊糖 戊糖的类型 b-D-核糖 RNA b-D-2-脱氧核糖 DNA 戊糖 糖环的折叠形式 内型（endo）与外型（exo）构象——以C5’作为参照 糖环的折叠形式有两大类 信封式（envelope form） C2’-endo（2E） C3’-endo（3E） C2’-exo （2E） C3’-exo （3E） 扭转式（twist form） C2’-endo-C3’-exo（ , , ），又称S式 C2’-exo-C3’-endo（ , , ），又称N式 内型（endo）与外型（exo） 信封式构象 扭转式构象 呋喃糖环的折叠形式 糖环的折叠影响核苷酸的空间构象 单体核苷酸中糖环折叠C3’-endo与C2’-endo各占一半的比例 B-DNA螺旋中糖环构象为C2’-endo A-DNA螺旋中糖环构象为C3’-endo RNA螺旋中糖环构象为C3’-endo 碱基 腺嘌呤 A 鸟嘌呤 G 胞嘧啶 C 胸腺嘧啶 T 尿嘧啶 U 碱基环的原子编号 碱基的顺式和反式构象 碱基的顺式和反式构象 磷酸基团 核苷酸的构象角 DNA的结构 DNA的一级结构 双螺旋——DNA的二级结构 超螺旋——DNA的三级结构 三链和四链DNA的结构 DNA的一级结构 DNA的一级结构是脱氧核糖核苷酸以3, 5-磷酸二酯键连接形成的长链 脱氧核糖和磷酸构成DNA的磷酸二酯主链，由糖苷键连接的碱基是DNA的侧链 磷酸基总是离子化的 核酸是聚阴离子 核苷酸链具有极性，方向：5’?3’ 每个核苷酸中有6-7个自由旋转的单键 核苷酸的序列编码了DNA中的遗传信息 Chargaff规则：双链DNA中 A = T G = C 核苷酸中的碱基可以被修饰：DNA中A和 C有时被甲基化 DNA序列的测定 Sanger法（双脱氧末端终止法） Maxam-Gilbert法（化学降解法） DNA的双螺旋结构——二级结构 双螺旋结构的三种类型 B-DNA A-DNA Z-DNA B型DNA的结构 B型DNA是天然DNA的最常见的构象，Watson-Crick双螺旋模型就是B型DNA的构象 B型DNA的结构特征 两条反平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕。 磷酸-脱氧核糖主链在外，碱基在内。碱基平面相互平行叠加，与中心轴垂直，碱基平面的间距为3.4?。 每圈螺旋含有10对碱基，螺距34?。相邻两对碱基的夹角为36°，螺旋的直径约为20?。 两条链相对的碱基存在A-T, C-G的互补关