BioPerl安装指南.pdf

w 页码，1/7(W)  Home  关于网站  文章存档  友情链接  留言本  RSS订阅 Enter your search keywor  SUBSCRIBE TO THE RSS FEED  中文Entrez序列查询工具--点击进入试用  Biocompute»  生物信息学  生物信息软件  Lc.摄影  Life»  每周精选  WordPress Categorized | Biocompute Tags | ActivePerl, Bioperl, Linux, 指南 BioPerl指南:Unix/Linux/Windows下的安装 Posted on 06 七月 2009 by 柳城 ，阅读 1,091 简洁版 繁體 其实BioPerl 的功能很强大。但是用的人却不多。最根本的原因可能是，太多数人都还是新 手，相对而言Perl很难懂，不懂Perl 的人根本搞不懂BioPerl 。而且BioPerl安装也很复杂。又不 像Perl一样打包成一个安装包，一键安装。 到现在，我前前后后安装过BioPerl好几次，每次都觉得很复杂，很难懂。我又不是计算机专 业出身的，真的是连最基本的计算机算法或原理都是不懂的。我学BioPerl 的确感到吃力。所 以，接触了BioPerl这么久，都只是用BioPerl从NCBI上拿序列。其它的功能还没真正接触。 接下来可能花些时间慢慢学习。首先先安装好Perl （/get.html ） ActivePerl 005 /765/ 2010/1/21 w 页码，2/7(W) Platform Download Windows (x86) Windows Installer (MSI) | AS Package (ZIP) Windows (64-bit, x64) Windows Installer (MSI) | AS Package (ZIP) Mac OS X (Universal) Mac Disk Image (DMG) Linux (x86) AS Package | RPM | Debian Package Linux (x86_64) AS Package | RPM | Debian Package Solaris 8+ (SPARC) AS Package | Solaris Package Solaris 8+ (SPARC 64-bit) AS Package | Solaris Package Solaris (x86) AS Package | Solaris Package AIX 5 (PowerPC) AS Package 下面先来介绍一下怎样在Unix/linux下的安装BioPerl 。复杂的方法我就不讲了，只讲我理解得 来的。 1，用CPAN安装 perl -MCPAN -e shell cpand /bioperl/ CPAN: Storable loaded ok Going to read /home/bosborne/.cpan/Metadata Database was generated on Mon, 20 Nov 2006 05:24:36 GMT Distribution B/BI/BIRNEY/bioperl-1.2.tar.gz Distribution B/BI/BIRNEY/bioperl-1.4.tar.gz Distribution S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz 选择一个安装 cpaninstall S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz 或是用force强制安装。这样不会报错。推荐。 cpanforce install S/SE