药剂学第六章进化.pptVIP

* 第六章 病毒的进化 生命科学与技术学院 李 灏 lihaoh@163.com * 第六章 病毒的进化 第一节 有关病毒起源的学说 第二节 病毒进化的机制 第三节 研究病毒分子进化的有关方法 第四节 DNA病毒的进化 第五节 RNA病毒的进化 * 病毒的发生、进化乃至生命的起源，是生物学研究的一个重要课题。由于病毒特别小只有在电镜下放大几万至几十万倍才能看到，加上病毒在漫长的演化史中没有“化石”或“遗体”可供研究，所以病毒发生和进化的研究相当困难。我们只能通过研究同时代的病毒来推测病毒的演化过程。 第一节 有关病毒起源的学说 * 病毒的起源：病毒或其遗传物质从它的前身大分子中独 立出来进行自主复制和进化的时候，定义 为病毒的起源。 当病毒获得了决定自身繁殖和命运的遗传信息时，它就获得 了新的分类地位成为独立的遗传元件。 病毒的起源有三类学说： A、退化性起源学说； B、病毒起源于宿主细胞中的RNA和（或）DNA成分的学说； C、病毒起源于具有自主复制功能的原始大分子的学说。 * 认为病毒是由较高级的细胞内寄生生物退化形成的。受外界环境的影响，细胞内寄生生物逐渐丢失大部分遗传物质，只保留了最基本的复制和维持寄生生活所必须的基因，不能自身繁殖，必须依赖于宿主细胞才能完成基本的新陈代谢和繁殖。 退化性起源学说可以把病毒的起源解释为两个阶段：首先,寄生物在细胞内产生独立复制的DNA质粒；然后,编码寄生物亚细胞结构单位的基因发生突变,形成病毒的衣壳蛋白。随着进化的发生,新获得的可在细胞间转移的特性被进一步选择下来。 一、退化性起源学说 * 这种学说认为，病毒是正常的细胞组分在进化过程中获得了自主复制的能力独立进化而来的。该学说能解释所有病毒的起源：DNA病毒起源于质粒或转移因子；反转录病毒起源于反转座子；RNA病毒起源于自主复制的mRNA。 二、病毒起源于宿主细胞中的RNA和（或）DNA成分的学说 * 三、病毒起源于具有自主复制功能的原始大分子的学说 即病毒起源于自主复制的RNA分子。核糖核酸多聚体具有自主复制的信息和能力。由于发现RNA分子具有催化化学反应的能力使得RNA为生命和病毒的起源的学说变得更具有吸引力。小而简单的RNA分子具有至少下列三种化学功能：1)核糖核酸酶的活性；2)能自我拼接去掉内部的核酸序列(核酸)；3)有实验表明，以RNA作引物可以合成依赖于模板的多聚胞嘧啶核酸。也就是说，RNA分子可以进行复制和进化相关的三个基本反应。 * RNA催化活性的发现解决了以往关于先有多聚核苷酸还是先有多肽链的两难困境，表明最初的生化系统整个地集中在RNA。 RNA世界的核心内容：作为核酶的RNA可以任意方式作为模板，进行缓慢地自发地复制。 最初的RNA分子复制产生的RNA分子已经具备生命所具有的两种基本属性：因为复制，成为遗传信息载体；可以催化，直接扮演了表型的角色。 这些RNA组成了原基因组（protogenome），形成了一个能自我复制和指令简单生化反应的体系。 RNA世界 * 基因组的起源 RNA世界转变为DNA世界的关键一步：具有酶学活性的蛋白质的出现，可以补偿并最终取代核酶的大部分催化活性。 RNA的催化活性转移到蛋白质是RNA原始基因组功能的根本性改变，使RNA与蛋白质的分工逐渐明朗，进而提高了整个生化系统的效率。RNA原始基因组的主要功能逐步转向指令蛋白质合成。 DNA比RNA结构更为稳定，RNA的编码功能转移到DNA是一种必然趋势。 RNA世界向DNA世界的过渡过程： 兼具催化和编码功能的RNA大分子最先出现 RNA催化肽键形成并合成蛋白质 RNA与蛋白质联手以RNA为模板合成DNA * 第二节 病毒进化的机制 病毒以最少的基因组合产生最大的多样性。病毒基因突变（包括转换、插入、缺失、颠换；重组、重配等）和自然选择是病毒进化（virus evolution）的基础，也是病毒多样化的基础。 * 病毒进化的机制： 一．基因突变是病毒进化的基础，高频率的基因突 变是病毒进化的基本条件 二．病毒遗传信息的交换 三．自然选择（natural selection） * 一．基因突变是病毒进化的基础，高频率的基因突变是病毒进化的基本条件 多数RNA病毒基因组的复制是以RNA中间体作为模板进行的，其复制错配率为1/105-1/10