基于SNP标记的黄瓜杂交种纯度鉴定方法.pdfVIP

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2017-06-13 发布于山东
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中国蔬菜 2012（6）：58-63 CHINA VEGETABLES 基于SNP 标记的黄瓜杂交种纯度鉴定方法 11 22 1*1* 11 11 22 1 1 11 22 1*1* 11 11 22 11 兰青阔兰青阔张桂华张桂华王王永永赵赵新新朱朱珠珠崔兴华崔兴华郭永泽郭永泽兰青阔兰青阔张桂华张桂华王王永永赵赵新新朱朱珠珠崔兴华崔兴华郭永泽郭永泽 11 程程奕奕 11 程程奕奕 1 2 （天津市农业科学院中心实验室，天津 300381；天津科润农业科技股份有限公司黄瓜研究所，天津 300192）摘要：根据国际葫芦科基因组数据库 CuGenDB 中序列信息，应用高分辨率熔解曲线技术筛选出用于黄瓜杂交种纯度鉴定的 SNP 位点 CLA6（A/G），该位点在 33 个市售黄瓜品种中的多态信息量为 0.401，处于中度多态；结合焦磷酸测序技术，建立基于 CLA6 位点的 SNP-Pyrosequencing 黄瓜杂交种纯度鉴定方法。利用该鉴定方法检测黄瓜杂交种优一 90 粒种子，结果其种子纯度为 96.7%，该结果与 CLA0 位点及 SSR 鉴定结果相符，表明该鉴定技术适于黄瓜杂交种纯度鉴定，具有用于 DUS 测试分析的潜力。关键词：黄瓜；种子纯度；高分辨率溶解曲线；SNP 标记；焦磷酸测序中图分类号：S642.2 文献标识码：A 文章编号： 1000-6346（2012）06-0058-06 SNP-based Molecular Assay for Cucumber Hybrid Seed Purity Iden- tification by Pyrosequencing 1 2 1* 1 1 2 LAN Qing-kuo ，ZHANG Gui-hua ，WANG Yong ，ZHAO Xin ，ZHU Zhu ，CUI Xing-hua ，GUO 1 1 Yong-ze ，CHENG Yi 1 2 （Central Lab of Tianjin Academy of Agricultural Sciences，Tianjin 300381，China ； Cucumber Research Institute of Tianjin Kernel Agricultural Science and Technology Co.，Ltd. ，Tianjin 300192，China ） Abstract ：For the purpose of testing cucumber（Cucumi