第四章 EHRSC POC 测试数据集检验项目映射初探.pdfVIP

EHRSC POC 测试数据集检验项目映射初探 ① ② ③ ③ 张林 李包罗 薛万国 张震江 ①解放军白求恩国际和平医院，050082，石家庄市中山西路 398 号 ②北京协和医院，100730，北京市东城区王府井帅府园 1 号 ③解放军总医院，100000，北京西郊万寿路五棵松 1 前言 此研究旨在为 EHRSC 的 POC 演示项目测试数据集建立本地检验报告项目与 LOINC® （Logical Observation Identifiers Names and Codes，观测指标标识符逻辑命名与编 码系统）代码之间的映射关系。本地检验报告项目字典与标准受控医学词表（CMVs）之间 的映射关系，对于实现语义互操作，具有不可或缺的重要作用，是测试数据集的一个关键 组成要素。 2 材料来源 2.1 本地字典 医院检验项目字典数据与相应的临床检验结果测试数据集相配套，分别来 自军地两家大型医院。下文将把军地这两家医院分别称为J医院和D医院。 2.2 LOINC 数据库 英文版及其简体中文版来自 LOINC 委员会。LOINC 数据库为 2.22 版 （2007年12月）；该版本共计收录术语50809条；其中，实验室检验项目代码37,654条， [1] 涉及23个实验室专业（如化学、血液学、血清学、微生物学以及分子病理学等等） 。 2.3 LOINC 映射工具 英文版工具为 3.23 版 Regenstrief LOINC 映射辅助程序 （Regenstrief LOINC Mapping Assistant, RELMA®，Regenstrief LOINC对照辅助程序） [2]；中文版工具：基于Eclipse编制。 3 步骤与方法 3.1 本地字典的准备 本地字典情况的初步分析：总体了解字典结构与数据质量，发现问 题，为进一步的预处理提供指导和依据。 本地字典情况的整理：针对POC测试工作的目标，结合临床检验结果测试数据集，对 413 本地字典数据加以整理和补充（比如，补充执行科室、标本和计量单位信息以及示例数据 和正常参考值范围）。 3.2 本地字典数据的导入 综合采用本地字典以及测试数据之中的必要信息，来填充本地 术语文件（Local Term File）数据库之中映射工作所需的必备字段（比如，将项目的中 文全称、英文全称以及缩写合并为一个字段），为映射工作做好充分的资料准备。 3.3 标准词表与本地字典之间的映射 利用映射工具 RELMA，对于本地字典之中的检验项 目（报告项目）逐一加以映射。依据所的导入本地字典数据，借助于RELMA，在LOINC数 据库之中进行搜索，找出与之匹配的LOINC代码，并加以记录。采用基于Eclipse所编制 的中文版映射工具加以核对。 4 结果 4.1 本地字典概况 本地检验报告项目主要用于检验结果的显示与打印。分析发现，两个 医院的本地检验报告项目具有下列特点。 4.1.1D 医院的本地检验报告项目代码缺乏唯一性，需要结合收费代码和/或组合项目代 码；命名缺乏统一，但中英文及其缩写信息较为丰富；部分项目缺乏计量单位、标本、成 分等映射工作所需的必要信息；部分代码带有版本（日期）信息；与LOINC概念相比，存 在少数无法找到确切粒度的情况。 4.1.2J医院的本地检验报告项目代码唯一性相对较好 （在示例临床数据之中,存在少数因 为标本类型录入错误而影响代码唯一性方面质量的情况。比如，编码为“104001A”的项 目有下列两种：[[静脉血] [脑脊液颜色]] 和 [[脑脊液] [脑脊液颜色]]）；命名规范， 较为统一；部分项目缺乏计量单位、标本、成分等映射工作所需的必要信息；缺乏版本信 息；与LOINC概念相比，存在少数无法找到确切粒度的情况。 本地字典所提供的检验项目集合大于测试数据之中所实际使用的检验项目集合。也就 是说，后者仅仅是前者的一个子集。微生物学检验项目，尤其是培养及药敏试验，缺乏相 应的报告项目以及示例数据（可能是因为微生物实验室尚未采用与HIS相连的信息系统）。 确切