临床常见镰刀菌rDNA ITS序列分析.pdfVIP

·Z-Z · K%-8)5 %; D5==I)5 )H FL7 48=:4()5 G4H=I=4 M%56 . ，1%6 Z) K-46 *++Z 临床常见镰刀菌!#$ %’ 序列分析 论著 ( ( ( * * ( ( 窦红涛 ) 李若瑜 ) 万哲 ) 李然 ) 孙旭光 ) 卜定方 ) 王端礼 （( 北京大学第一医院皮肤科) 北京) (+++,- ；* 首都医科大学同仁眼科中心) 北京) (++++. ） 【摘要】) 目的) 探讨!#$ %’ 序列分析用于快速鉴定临床常见镰刀菌的方法，为临床早期诊断镰刀菌感染提供依据。 方法) 选择临床常见的茄病镰刀菌、串珠镰刀菌、尖孢镰刀菌和半裸镰刀菌，提取基因组#$ ，用真菌通用引物%’(、 %’- 、/01 扩增!#$ %’ ，纯化后测定其序列，所得序列在2345647 核酸序列数据库中进行同源序列搜索，并和其中镰 刀菌标准株的!#$ %’ 序列进行序列比对。利用089:;68 软件将序列匹配排列，进行(+++ 次=;:;!6? 统计学检验，用 !33@A3B 软件显示系统树。结果) !#$ %’ 序列分析的结果与表型基本一致，以前经形态学鉴定的* 株串珠镰刀菌经 过!#$ %’ 序列分析鉴定为层生镰刀菌。系统树显示茄病镰刀菌和标准株聚在一起，串珠镰刀菌大部分也和标准株聚 在一起。结论) 形态学鉴定镰刀菌有一定的局限性，!#$ %’ 序列分析可用于快速鉴定临床常见的镰刀菌。 【关键词】) 镰刀菌) !#$) %’) 序列分析 !#$% ’%’()*+* ,- .+/,*,0’( 123 45! ,- (+%+’( ,00,% 6$*’.+$0 *7+*8 !# $%’ C ()%( ，*+ ,-% C .-( ，/01 234( ，4( )56 ( !47 )8(9 :4( %; !48:)(%5%’. ，(34 =8( $%7 =()5 %; ?4@=’ #=A48=(. ，B4=C =’ (+++,- ，D3=) ；* B4=C =’ E%’84 F.4 D4(48 ，D)7 =()5 #=A48=(. %; G4H=I)5 JI=9 4I4 ，B4=C =’ (++++. ，D3=)6 【3/*9.’9 】) :/;9+) :;9DE !6?AD AD34;AFAG6;A4 H3;ID F G8A4AG688E A:86;3D GHH4 J9:6!A9H :?? ，?!KADA4L ;I3 =6:A: F! 36!8E DA6L4:A: F J9:6!A9H A4F3G;A4M =9,?*) 08A4AG68E A:86;3D GHH4 J9:6!A9H :?? ，:9GI 6: J9:!A9H :864A 、J9:!A9H H4A8AF!H3 、J9:!A9H NE:?!9H 64D J9:!A9H :3HA;3G;9H B3!3 :383G;3DM I3A! L34HAG #$: B3!3 3N;!6G;3DM J94L68 L343!68 ?!AH3!: F %’(、%’- B3!3 9:3D ; 6H?8AFE ;I3 A4;3!468 ;!64:G!A=3D :?6G3! F !#$ F ;I3 J9:6!A9H :?? ;3:;3DM $F;3! ?9!AFAG6;A4 ，;I3 /01 ?!D9G;: B3!3 :3O934G3D DA!3G;8EM J! ;I3 :3O934G3: 6GO9A!3D ， IH8L9: :3O934G3: B3!3 :36!GI3D A4 2343=647 ，;I3 49G83AG 6GAD :3O934G3 D6;6=6:3 ；;I3 :3O934G3: 6GO9A!3D B3!3 ?6A!3D BA;I :3O934G3: F !P #$ %’ F :;64D6!D :;!6A4 F J9:6!A9H F94D A4 2343=647M /IE8L34;AG ;!33 B3!3 DA:?86E3D =