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临床常见镰刀菌rDNA ITS序列分析
·Z-Z · K%-8)5 %; D5==I)5 )H FL7 48=:4()5 G4H=I=4 M%56 . ,1%6 Z) K-46 *++Z
临床常见镰刀菌!#$ %’ 序列分析 论著
( ( ( * * ( (
窦红涛 ) 李若瑜 ) 万哲 ) 李然 ) 孙旭光 ) 卜定方 ) 王端礼
(( 北京大学第一医院皮肤科) 北京) (+++,- ;* 首都医科大学同仁眼科中心) 北京) (++++. )
【摘要】) 目的) 探讨!#$ %’ 序列分析用于快速鉴定临床常见镰刀菌的方法,为临床早期诊断镰刀菌感染提供依据。
方法) 选择临床常见的茄病镰刀菌、串珠镰刀菌、尖孢镰刀菌和半裸镰刀菌,提取基因组#$ ,用真菌通用引物%’(、
%’- 、/01 扩增!#$ %’ ,纯化后测定其序列,所得序列在2345647 核酸序列数据库中进行同源序列搜索,并和其中镰
刀菌标准株的!#$ %’ 序列进行序列比对。利用089:;68 软件将序列匹配排列,进行(+++ 次=;:;!6? 统计学检验,用
!33@A3B 软件显示系统树。结果) !#$ %’ 序列分析的结果与表型基本一致,以前经形态学鉴定的* 株串珠镰刀菌经
过!#$ %’ 序列分析鉴定为层生镰刀菌。系统树显示茄病镰刀菌和标准株聚在一起,串珠镰刀菌大部分也和标准株聚
在一起。结论) 形态学鉴定镰刀菌有一定的局限性,!#$ %’ 序列分析可用于快速鉴定临床常见的镰刀菌。
【关键词】) 镰刀菌) !#$) %’) 序列分析
!#$% ’%’()*+* ,- .+/,*,0’( 123 45! ,- (+%+’( ,00,% 6$*’.+$0 *7+*8 !# $%’ C ()%( ,*+ ,-% C .-( ,/01 234( ,4( )56 ( !47 )8(9
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