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SSR标记评价西瓜品种的一致性
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SSR标记评价西瓜品种的一致性
李丽 张力 刘玲 马连平
1北京市蔬菜种子质量监督检验测试中心,北京 10097;2北京市农林科学院蔬菜研究中心、农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制
重点实验室、农业部都市农业(北方)重点实验室,北京 100097;3北京市种子管理站,北京 100088
通讯作者 lili@nercv.org;bjzhli2005@126.com
摘 要 为了评价SSR标记对西瓜品种一致性鉴定的可行性,以及建立依据SSR标记 的西瓜一致性鉴
定标准,本研究采用 11对西瓜SSR引物,检测了78个西瓜(Citrulluslanatus)品种以及2009-2013连续5个
年度北京市西瓜区域试验97个品种的11个SSR标记位点的一致性 比率。每个品种取48个个体,每条染
色体上选取一个标记 。通过统计 11对核心引物对 175个西瓜品种的检测结果 以及不同品种在不同位点
的一致性分布的特征特性,发现品种 内的随机单株个体在不同引物位点中一致性分布情况都不一样,品
种 内单株的某一个SSR位点的一致性比率不代表这个品种的一致性,也不能简单的依据 品种 内个体的某
一 个SSR位点的一致性 比率来评估这个品种的一致性,需要综合品种内随机单株个体 11个位点的平均
一 致性 比率来评价其一致性。综合分析西瓜11对SSR核心引物对 175个品种一致性比率的统计结果,提
出可以将SSR位点一致性比率作为评价西瓜品种一致性的辅助标准,判断西瓜品种的一致性时,需综合
单个引物的一致性r和所有引物位点的平均一致性比率 R两个指标进行评价,将西瓜品种一致性级别分
为5级,并说明了利用SSR标记评估西瓜品种一致性的指标以及检测方法 中需注意的细节,初步拟 出西
瓜一致性评估标准。
关键词 西瓜,SSR标记 ,一致性比率,一致性,DUS测试
Uniformity Analysis ofWatemr elon (Citrullus lanatus)Varieties
AmplifiedSSRMarkers
LILi ZHANG L LIU Ling MA Lian—Ping
!Supervision,InspectionandTestCenterofVegetableSeedQuality,Beijing100097,China;2BeijingVegetableResearchCenter,Beijing
AcademyofAgricultureandForestrySciences,KeyLaboratory ofBiologyandGeneticImprovementofHorticulturalCrops(NorthChina),
MinistryofAgriculture,KeyLaboratoryofUrbanAgriculture(North),MinistryofAgriculture,Beijing100097,China;3Be0ingOfficialSeed
TestingStation,Beijing100088,China
Correspondingauthor,lili@nercv.org;bjzhli2005@126.com
Abstract Thegoalofthisresearch iSto assesstheavailability ofSSR markersforvariety testing in
watermelonhybridsandtrytoestablishastandardofrvarietyuniformitytestingbySSRmarkers.A setOf1l
primerpairswereappliedofr78watemr elon(Citrulluslanatus)varietiesand97watemr
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