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RAPD分标记技术
;分子标记的类型;
③基于 PCR的分子标记,它又分为两类:
RAPD (Random amplified polymorphic DNA)
DAF(DNA amplification fingerprinting)
SSCP(Single strand confirmational polymorphism)
小卫星DNA(Minisatellite DNA)
微卫星DNA(Microsatellite DNA),又称SSR(Simple sequence repeat)
ISSR(Inter simple sequence repeat)
AP-PCR(Arbitrary primer PCR)
它主要有SCAR(Sequence characterized amplified region)
STS (Sequence tagged site)
;RAPD标记的原理; ; RAPD所使用的引物各不相同,但对任一特定引物,它在基因组DNA序列上有其特定的结合位点,这些特异的结合位点在基因组某些区域内的分布如符合PCR扩增反应的条件,即引物在模板的两条链上有互补位置,且引物3’端相距在一定的长度范围内,就可以扩增出DNA片段。
一旦基因组在这些区域发生DAN片段插人、缺失或碱基突变,就可能导致这些特???结合位点的分布发生变化,从而导致扩增产物数量和大小发生改变,表现出多态性。就单一引物而言,其只能检测基因组特定区域DNA多态性,但利用一系列引物则可使检测区域扩大到整个基因组,因此,RAPD可用于对整个基因组DNA进行多态性检测,也可用于构建基因组指纹图谱。;PCR;RAPD;RAPD;RAPD;RAPD;Template DNA;M;;;3.DNA扩增;4.扩增产物的分离检测和记录;综上,RAPD操作过程概括如下:; RAPD标记的主要特点有:
(1)不需DNA探针,设计引物无须知道序列信息;
(2) DNA样品需要量少,引物价格便宜,成本较低;
(3)技术简便,不涉及分子杂交和放射性自显影等技术;
(4)显性遗传(极少数共显性),不能鉴别杂合子和纯合子;
(5)实验重复性较差,结果可靠性较低。
;RAPD标记的应用
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