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LncRNA and circRNA研究原理
LncRNA研究策略
1
LncRNA (long non-coding RNA )简介
LncRNA是RNA聚合酶II转录的产物 ,具有poly A尾结构 ;不编码
蛋白 ;物种间不保守 ;通常位于核内 ;
small non-coding RNA (sncRNA)
(20-200nt)
non-coding RNA
(20-20000nt)
long non-coding RNA (lncRNA)
RNA
(200-20000nt)
mRNA
2
LncRNA已知功能
1) 在编码蛋白基因的上游启动子区 (橘色 )转录 ,从而
干扰邻近蛋白编码基因 (蓝色 )的表达
2) 抑制RNA 聚合酶 Ⅱ ,或介导染色质重构和组蛋白修
饰 ,而影响基因 (蓝色 )表达 ;
3) lncRNA (紫色 )与编码蛋白基因的转录本形成互补
双链 ,干扰mRNA的剪切 ,进而产生不同的剪切形式 ;
4) lncRNA (紫色 )与编码蛋白基因的转录本形成互补
双链 ,在Dicer酶作用下产生内源性的siRNA ,调控基因的
表达水平 ;
5) lncRNA (绿色 )结合在特定蛋白质上调节相应蛋白
的活性 ;
图 lncRNA的八种作用方式
6) 作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体 ;
7) 结合在特定蛋白上从而改变该蛋白的胞质定位 ; 机制切入点:
抑制基因表达;
8) 可作为小分子RNA (如miRNA )的前体分子或者 引导DNA-蛋白结合;
miRNA的反义抑制分子。
染色质重构,表观调控
3
Wilusz et al. Genes Dev. 2009. 23: 1494-1504. PMID:
LncRNA医学基础研究策略
临床/动物实验
样本收集
Gain of Function
汉恒强项
LncRNA功能验证 品质保证
差异LncRNA筛选
Loss of
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