基于微卫星标记的12个地方鸡种遗传多样性保护等级分析.ppt

1、摘要 2、材料 3、方法 4、结果 5、分析与讨论 　实验步骤 　　1. 收集标本(血液或组织等标本)并提取DNA。 　　2. 设计引物序列并扩增，琼脂糖电泳检测结果。 　　3. 合成荧光标记引物。 　　4. 进行PCR扩增，产物通过测序仪器电泳检测, 获得扩增片段大小。 　　5. 分析测序仪器读出的数据，给结果图谱。 基因组分数的分布 Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ程序是一种基于多位点基因型和等位基因频率数据推断群体结构的模型分类法，每个推断类别（Ｋ）均代表一组特定的基因型和等位基因频率类型，其根据每一个被分析个体的位点基因型和等位基因频率在所有推断类别中的分布比例（即基因组分数，＞０．８００），确定个体所属的品种类别，可用于分析各品种群体的遗传背景（相对独立或具有复杂的遗传基础）。采用Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ程序推断的１２个地方鸡种的群体基因组分数分布见表４。由表４可知，萧山鸡、鹿苑鸡和藏鸡群体的平均基因组分数在所属推断类别中均小于０．８００。 遗传多样性贡献率 Ｗｅｉｔｚｍａｎ保种理论的分析结果表明，１２个地方鸡种群体的现实多样性为１．５７９　２，固始鸡、河南斗鸡、茶花鸡、丝羽乌骨鸡对总群现实多样性的品种贡献率相对较高，且均超过１０％；鹿苑鸡、藏鸡和萧山鸡对总群现实多样性的品种贡献率较其他鸡种小，且均低于５％。Ｃａｂａｌｌｅｒｏ保种理论的分析结果表明，茶花鸡、河南斗鸡、北京油鸡、丝羽乌骨鸡、大骨鸡、藏鸡和萧山鸡对总群遗传多样性有正的贡献率，当该品种被从总群中移除时，分别会使总体遗传多样性减少０．９５６　８％，０．５００　９％，０．４９２　９％，０．１１２　９％，０．７７３　８％，０．０４５　２％和０．０２８　２％。 若仅以Ｃａｂａｌｌｅｒｏ保护理论中的品种间遗传多样性变化来确定保护等级，则１２个地方鸡品种对总群体遗传多样性具有正贡献率的品种及其贡献大小为：固始鸡＞河南斗鸡＞茶花鸡＞北京油鸡＞丝羽乌骨鸡＞狼山鸡＞白耳鸡，保护等级顺序与Ｗｅｉｔｚｍａｎ保护理论的分析结果几乎完全一致。因此，在分析地方鸡遗传资源多样性保护等级时，应充分考虑品种间和品种内的遗传多样性。同时，品种内的遗传多样性保护分析结果可以为制定保种方法提供参考。在藏鸡资源保护中，针对其丰富的品种内遗传多样性，在保种群体中建立不同品系更有利于保种实践。 后记 我们全体组员竭尽全力，做到最好！！在此鸣谢2-14号各位同仁！！大家有需要深入了解更多资讯可致电670496或加扣扣384907798（非诚勿扰） 多谢观看！ 基于微卫星标记的１２个地方鸡种遗传多样性保护等级分析 优秀组员： 陈杰 李忠雄 陈日辉 廖志军 陈雄明 廖攸辉 何国飞 何永标 何政晔 李泽英 组长ppt主讲：陈嘉文 指导老师：张丽 摘　要 【目的】分析我国地方鸡品种资源的遗传多样性保护等级，为我国地方鸡种资源遗传多样性保护方案的制定提供理论依据。【方法】采用１６个微卫星标记，计算我国１２个地方鸡品种（白耳鸡、茶花鸡、大骨鸡、河南斗鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、狼山鸡、鹿苑鸡、藏鸡、仙居鸡、萧山鸡、北京油鸡）间的ＤＲ遗传距离、基因流（Ｎｍ）、杂合度和各群体基因组分数的分布，并采用Ｗｅｉｔｚｍａｎ和Ｃａｂａｌｌｅｒｏ　２种遗传多样性保护理论，分析各品种在遗传多样性最大化保护中的相对重要性。【结果】固始鸡与其他１１个鸡种间的平均遗传距离最远（０．２０９　５），基因流最小（１．１４１　１）；藏鸡与其他１１个鸡种间的平均遗传距离最近（０．１０１　３），基因流最大（２．７７３　０）。１２个地方鸡种中，除萧山鸡、鹿苑鸡和藏鸡外，其他群体的基因组分数均大于０．８００。Ｗｅｉｔｚｍａｎ保种理论分析表明，固始鸡、河南斗鸡、茶花鸡、丝羽乌骨鸡、北京油鸡对总群现实多样性的品种贡献率较高（＞１０％），这与这几个鸡品种独特的特征特性和相对封闭的品种形成历史基本一致。Ｃａｂａｌｌｅｒｏ保种理论分析表明，茶花鸡、河南斗鸡、北京油鸡、丝羽乌骨鸡、大骨鸡、藏鸡和萧山鸡对总群的遗传多样性有正的贡献率，与Ｗｅｉｔｚｍａｎ保护理论确定的保护等级顺序相比，固始鸡、藏鸡和萧山鸡的保护等级发生了较大改变，这与Ｗｅｉｔｚｍａｎ保护理论未考虑品种内的遗传多样性有关。【结论】在分析家禽品种资源的遗传多样性保护等级时，应充分考虑品种间和品种内的遗传多样性。 ［关键词］　微卫星；地方鸡种；遗传多样性；保护等级 本研究拟采用Ｗｅｉｔｚｍａｎ和Ｃａｂａｌｌｅｒｏ　２种保种理论，综合评价我国１２个地方鸡种在遗传多样性最大化保护中的相对重要性，以期为今后更合理地制定我国地方鸡品种资源保护方案提供理论依据。 材料 1、鸡种 白耳鸡（ＢＡＩ）、茶花鸡（ＣＨＡ）、大骨鸡（ＤＡＧ）、河南斗鸡（ＤＯＵ）、丝羽乌骨鸡（ＷＵＧ）、固始鸡（ＧＵＳ）