创新NGS液体活检技术用于检测低频肿瘤突变.PDFVIP

创新的NGS液体活检技术用于检测低频肿瘤突变 Oncomine cfDNA 肺癌研究试剂盒的产品经理Thomas Bittick 发表了 《创新的NGS 液 体活检技术用于检测低频肿瘤突变》的主题演讲。 Thomas Bittick 是Thermofisher 最新开发的Oncomine cfDNA 肺癌研究试剂盒的产品 经理。他先介绍了液体活检和实体瘤检测的差异，让大家更加了解在无法获取病人 组织样本时，采用液体活检方法也一样能够及时地对病人开展检测，并且是更适合 对经过治疗的病人进行预后监控和管理。由此引出Thermofisher 基于NGS Ion 半导 体高通量测序平台的液体活检解决方案，在2 天的时间内即可完成从血浆样本到 用药建议报告的完整流程。这套方案中包含通过磁珠分选的方式从血浆冲提取病人 的cfDNA，配合高灵敏度的Oncomine cfDNA 肺癌研究试剂盒，在最先进的Chef 及 S5 全自动化测序平台上完成实验部分，最终结果经过Oncomine Knowledgebase 数 据库的全面解析，可以获得一份和突变信息匹配的目前欧美药监局批准的药物建议 和全球正在开展的公开临床实验信息报告。 Thermofisher 解决方案不仅仅是便捷的操作和一键式的分析系统，Oncomine cfDNA 肺癌研究试剂盒还是一款高灵敏度高精确度的检测试剂盒。当cfDNA 样本量仅有 20ng 的情况下，该试剂盒可以达到0.1%的检测下限。当然，即使仅有1ng 的 cfDNA 样本，也可以同样进行检测，只是限于其中DNA 拷贝数的限制，自然不可 能出现0.1%的突变。这款试剂盒可以检测肺癌最常见的11 个基因中超过168 个的 SNV 及Indel 突变。由于采取了全新的专利捕获技术，修正了常规PCR 中容易引入 的扩增错误，针对0.1%的突变，特异性也可以达到98%。 液体活检中最重要的就是结果的准确性。Thomas 给大家详细介绍了在研发这款试剂 盒时，我们的研发团队做非常多细致严谨的验证工作。他们购买了市面上多种合成质 控品，由于这些质控品都不适用于cfDNA 检测。他们将质控品人为打断至170bp 的 小片段来模拟cfDNA，同时用定量PCR 的方法精确确定突变频率。同时他们还用正常 的血浆样本作为阴性对照；用上述处理的质控品作为阳性对照，反复验证试剂盒性能 和实验流程。用Horizon 的标准品检测试剂盒的灵敏度和特异性，并购买真实的组织- 血液匹配的临床样本验证同一份样本中组织检测和液体活检的一致性。 最后Thomas 还分享了目前在欧洲和美国用户的体验，由于大约30-50%的非小细胞肺 癌患者都无法取得组织样本，Oncomine cfDNA 肺癌试剂盒真的是一款快速简便进行 EGFR 突变检测的实用工具，能够及时帮助医生为病人制定最适合的治疗方案。巴塞 罗那的病理实验室目前已经用这套NGS 的液体活检方法替代了之前的数字PCR 方法 来检测病人的病情进展。在年底，Thermofisher 还将推出同样用于液体活检针对结直 肠癌和乳腺癌的研究试剂盒，尽请期待。