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第10章基因组比较基因组学

第十章 基因组与比较基因组学研究 1985年:5月,R.Sinsheimer在加州 大学Santa Cruz分校主 持会议,讨论将人类基因组全部测序的可行性;12月,西特斯公司(Cetus Corp.)的 K.Mulli s和他的同事们发明了PCR技术,利用这项技术,科学家们能够在短时间内精确复制 成百万的DNA片段,从而不再为遗传物质的用量而担忧. 1986年:3月,美国能源部(Department of Energy , DO E)在新墨西哥州召开会议,讨论人类基因组测序计划;6月,科学家们齐聚纽约州冷泉港实 验室,以“人类的分子生物学”为题讨论人类基因组计划可能带来的利益和前景;同月,加 州理工学院的L.Hood和L.Smith共同发明了第一台DNA自动测序仪;9月,DOE 从1987年的财政预算中拨款530万美元,资助C.DeLisi开始基因组研究. 1987年:2月,W.Gibert从美国国家 研究委员会(Nation al Research Council, NRC)辞职,组建Genome公司,同时宣称该公司将参与人类基因组测 序工作,并将为测序结果申请专利;4月,一个专家小组建议DOE在未来7年内拨款10亿美元 ,用以进行人类基因图谱测定和基因组测序,DOE主持的人类基因组计划开始实施;5月,华 盛顿大学的D.Burke, M.Olson和G.Carle发明酵母人工染色体 (YAC)克隆技术,使插入片段 的长度扩大了10倍;10月,H.Donis-Keller发表了第一张带有403个遗传标 记的遗传图谱, 由此在全世界范围内引发了测序竞争;同月,杜邦公司将荧光链终止双脱氧技术引入到DNA 快速测序中;这一年,Applied Biosystems公司将第一台自动测序仪推上市场. 1988年:2月,在一份至关重要的报告中,NRC批准 了人 类基因组计划,并提出分阶段实施和每年2亿美元的拨款申请;3月,在许多专家的提议下, J.Wyngaarden在弗吉尼亚州Reston召开的会议上宣布,美国国立卫生研究院 (National Ins titutes of Health, NIH)应代替DOE成为人类基因组计划中的主要负责机构.在这之后, W yngaarden被任命为NIH主席;6月,第一届基因组年会在冷泉港召开;9月,NIH宣布成立人 类基因组研究办公室,并任命发现DNA双螺旋结构的J.Watson为主任;10月, NIH与DOE达成谅解备忘录,双方同意在人类基因组计划中团结协作. 1989年:1月,洛克菲勒大学的N.Zinder 主持了第一次H GP顾问委员会会议;9月,Olson, Hood, Botstein和Cantor共同描绘了基因图谱测定的新战 略;同月,DOE与NIH共同组建了一个委员会,以解决基因组计划可能带来的伦理、法律和 社会问题;10月,NIH的人类基因组研究办公室升级为人类基因组研究国家中心(National Center of Human Genome Research, NCHGR),并被授予拨款权. 1990年:L.Smith, B.Karger和N.Dovichi 分别领导的3个 小组各自独立地发展了毛细管电泳技术,这项技术后来被广泛应用于大规模测序中;4月,N IH和DOE一起发表了一个五年计划,内容包括测定完整的遗传图谱和物理图谱(每100 k b含一个标记),并在2005年之前完成模式生物的基因组测序;8月,NIH决定对四种模 式生物开 始大规模测序尝试.这四种模式生物是:支原体(Mycoplasma capricolum)、大肠杆菌 (Escheriachia coli)、线虫(Caenorhabditis elegans)和酿酒酵母(Sacch aromyces cerevisiae);10月,NIH和DOE宣布这一年的10月1日为人类基因组计划 的正式 启动时间.同月,生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information, N CBI)的D.Lipman与E.Myers发表了用于进行同源序列比较的BLAST算法. 1991年:6月,NIH的生物学家J.C.Venter 发表了一种发 现表达基因的新战略,即使用表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST);一个月之 后,Venter在国会听证会上披露,NIH堆积了上千份表达基因的专利申请,由此引发了一场 关于基因能否获得专利的大争论;10月,日本开始对水稻基因组测序;12月,用于基因查找 的第一个程序GRAIL开发成功. 1992年:4月,就基因申请专利的问题,Watson在与 B.Healy争论之后辞去了NCHGR主任的职

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