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1 蛋白质化学 β折叠在蛋白质中的不同形式 βαβ在蛋白质中(Rossmann folding) 核糖核酸酶A三级结构示意图 抹香鲸肌红蛋白（Myoglobin）的三级结构 血红蛋白四级结构 血红素(Heme)是铁卟啉化合物，由4个甲炔基相连成为一个环形，Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键，其中4个与吡咯环的N配位结合，1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合，氧则与Fe2+ 形成第6个配位键，接近第64位(E7)组氨酸。 ribonuclease A 五、蛋白质的四级结构 p83 (quaternary structure) 肝脏醇脱氢酶（α2) Some proteins contain two or more separate polypeptide chains, or subunits, which may be identical or different. The arrangement of these protein subunits in three-dimensional complexes constitutes quaternary structure. 五、蛋白质的四级结构(quaternary structure) 四级结构是由相同或不同亚基按照一定排列方式聚合而成的蛋白质结构。 去氧血红蛋白 寡聚蛋白：由两个或两个以上亚基组成的蛋白质统称～。 亚基：寡聚蛋白中的每个独立的三级结构单元。 维持四级结构稳定的作用力是疏水键、离子键、氢键、范德华力。 原体(protomer)：对称的寡聚蛋白质分子可视为由两个或多个相同结构成分组成,这种相同结构成分称为原聚体或原体。 例如：血红蛋白 (?2?2)的原体是??。 去氧血红蛋白 蛋白质的旋转对称 Rotational symmetry in proteins 环状对称 蛋白质的旋转对称 Rotational symmetry in proteins 二面体对称 一个二重旋转轴并以直角横切 蛋白质的旋转对称 Rotational symmetry in proteins 二十面对称 实例： 血红蛋白(α2β2) ?由4个多肽亚基组成，两个?亚基，两个?亚基组成 ?每个亚基都有一个血红素基和一个氧结合部位 ? ?亚基含有141个氨基酸残基 ? ?亚基含有146个氨基酸残基 ? ?亚基和?亚基的三级结构和肌红蛋白链的三级结构非常相似 O2 transport 组织 肺或鳃 静脉 动脉 脱氧血红蛋白 氧合血红蛋白 肌红蛋白 球状蛋白,寡聚蛋白,含四个亚基 两条α链,两条β链,α2β2 α链：141个残基; β链：146个残基 分子量65 000 含四个血红素辅基 亲水性侧链基团在分子表面，疏水性基团在分子内部 烟草花叶病毒（TMV） 每3圈49个蛋白质亚基，螺距2.3nm，右手螺旋。 烟草花叶病毒外壳蛋白（亚基） 微原纤维(4个右手卷曲的螺旋对) 原丝(两个α-螺旋形成的卷曲的螺旋) 初原丝(卷曲的螺旋对) 六、蛋白质空间结构稳定的因素 p73 稳定蛋白质三维结构的作用力主要是一些所谓弱的相互作用或称非共价键或次级键，包括氢键、范德华力、疏水作用和盐键（离子键），此外还有共价二硫键、酯键和配位键。 氢键 离子键 吸引 排斥 疏水作用 范德华力 四种典型的非共价键 构型与构象 构型：立体异构体分子中取代原子或基团在空间的取向，如几何异构体和光学异构体。构型互变需要共价键的断裂。 构象：取代基团当单键旋转时形成不同的立体结构，这种空间位置的改变不涉及共价键的断裂。 二氯乙烷 定义：是一种由弱酸性的供体基团（D-H）和一个具独对电子的原子（A）之间形成的最显著的静电作用力。（p75） 　在生物系统中，D和A两者都是高电负性的N和O以及S原子。 举例 ：蛋白质分子中的氢键示意图 1、氢键 生物体系中常见氢键 氢受体通常是氧或氮; 氢受体是另一个电负性原子. 氢供体 氢受体 蛋白质化学 * 1.1 氨基酸 1.2 肽 1.3 蛋白质的分子结构 1.4 蛋白质结构和功能的关系 1.5 蛋白质的重要性质 1.6 蛋白质的分类 1.7 蛋白质的分离与鉴定 1.3 蛋白质的分子结构? 一级结构(p41） : 氨基酸序列和二硫键的位置 二级结构(p57）：主链规律的空间排列 (α-螺旋, β-折叠) 超二级结构 结构域（domain） 三级结构(p70）：所有原子空间位置 四级结构(p83）：多肽链间的相互关系 维持蛋白质空间结构稳定的因素 我们将要学到的…… 三、蛋白质的超二级结构和结构域 1、超二级结构（