ubuntu环境下用MPI搭建集群.docxVIP

单机配置一、安装ubuntu系统安装系统时，保证各主机的用户名相同。二、安装MPI过程如下：下载MPICH地址：/解压MPICH可以解压到任意一目录下建议解压到主目录下，如/home/chen新建一个安装目录如在主目录下创建一文件夹mpi_install保证每个机器的安装位置相同用Ctrl+Alt+T，打开一个终端利用cd命令切换到MPICH解压后的目录在MPICH解压后的目录下执行：./configure -prefix=”安装目录”可以用命令./configure -prefix=/home/chen/mpi_install/，将MPICH安装到目录/home/chen/mpi_install/下执行make 执行make install退到主目录cd ~把mpi安装包的bin加到环境变量PATH下，在该用户的主目录下（如/home/chen）找到文件.bashrc,在文件最后加上：export PATH=$PATH:/home/chen/mpi_install/bin如果文件被隐藏的话可以按Ctrl+H，显示被隐藏的文件或文件夹/home/chen/mpi_install/bin是MPI安装形成的可执行文件位置执行source .bashrcSource命令也称为“点命令”，也就是一个点符号（.）。source命令通常用于重新执行刚修改的初始化文件，使之立即生效，而不必注销并重新登录用法： source.filename或 source filename在该用户的主目录下（如/home/chen）新建文件.mpd.conf(是root用户在/etc下建),修改其属性为600命令是：chmod 600 /home/chen/.mpd.conf然后在文件文件.mpd.conf里添加：MPD_SECRETWORD=＊＊＊＊＊＊“＝”号后的密码自行设定，这句的内容在各主机要保持一致用mpd 和mpdtrace测试本机是否安装好，如果成功则mpdtrace会打印主机名，用mpdallexit撤销所生成的mpd.命令依次如下：mpd mpdtrace(该命令打印出主机信息才表示安装好)mpdallexit多机配置一、多机配置之mpd.hosts在每个主机都如上述两大步安装在当前用户的主文件夹下形成文件mpd.hosts，将用到的主机名加入，每行一个注意mpd.hosts中的主机名要在各个主机的/etc/hosts（这个文件的配置是十分重要）中定义二、多机配置之配置ssh安装ssh后台进程，依次执行以下两步执行sudo apt-get install openssh-server，系统会自己安装执行sudo /etc/init.d/ssh start 进行重启修改所有机器上的/etc/hosts文件，在里面添加上参与计算的机器名和ip地址/etc/hosts文件的内容除第一行，剩余的是“IP-主机”对，这里的主机要互相做好ssh无密码连接/etc/hosts文件的内容一般如下：localhost05RAO00107CAO001……比如本文中有两台机器参加的例子里，hosts文件应当为： localhost42 node03 node1……这里的意思是说，主机名为node0的机器ip地址为42，主机名为node1的机器ip地址为3。注意将/etc/hostname文件中的该主机的主机名改成和/etc/hosts中用到的主机名相同MPI的多机并行是用mpdboot来管理启动的，是由参与计算的其中一台机器通过mpdboot同时启动其他机器上的mpd管理器并运行相应MPI程序的，所以，需要赋予运行mpdboot的机器执行其他机器上程序的能力。MPICH2支持通过ssh和rsh来做到这一点，其中ssh是默认的，而且其安全性也优于rsh，因此，我在项目中是用的ssh。创建ssh密钥命令行下：#ssh-keygen -t dsa直接按回车键执行到最后这样就在当前用户的home目录下生成了一个.ssh目录在.ssh目录下新建文件authorized_keys将～/.ssh下的id_dsa.pub文件内容拷贝到服务器～/.ssh/authorized_keysauthorized_keys文件中每一段代表一个机器的id_dsa.pub（公钥），这样当别的主机发送ssh请求，服务器就从authorized_keys中找相应的主机公钥，对请求主机发验证，请求主机有该公钥的私钥，就可以验证通过。假设服务器主机名为node1在客户机上键入ssh node1根据提示键入yes即可登录到node1这里的服务器只是从访问和被访问的角度上来区别的服务器将自己生成的公钥放到别的主机authorized_keys文件中就可以访问别的主机。ssh node1 默认会去连接同