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- 2017-06-22 发布于河南
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POPGEN1.32操作
我采用的是ISSR和RAPD分子标记,属于显性标记。以下是自己操作的步骤:
第一步
在EXCEL表格里面输入1、0数据,1代表有扩增的条带;0代表无扩增的条带。
在文本格式里,利用编辑菜单里的替换变成如下格式:
在文本编辑里把蓝色的方条全部替换成上述1、0格式。
前期第一步主要是格式的转化,横排数据是扩增的位点数目;竖排数据是居群采集样品数目。每个居群之间要空出一行,这个在EXCEL里进行插入行进行操作。如下4个居群的格式。
第二步骤:开始利用POPGEN软件进行操作
在文件菜单里选择打开loaddata里选择dominant显性或co-dominant共显性进行登录数据。
再选择dominant显性或co-dominant进行计算。
具体操作参见POPGEN操作手册。
上述数据均在该软件里进行计算。由于本人的能力有限,详细步骤请参见POPGEN手册里的操作步骤。
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