建立并验证新模型剖析.doc

一.设计新的缓蚀剂 目的:阐明了使用描述符计算和统计模型来设计新的分子。 时间: Visualizer模块:材料,定量构效关系,Forcite(可选) 先决条件:没有 二.背景 腐蚀是一个真正的挑战,许多化工企业,以及正在一个难题要学习科学(Grafen苏达权等,1985)。腐蚀是发现在循环水系统、油井、建筑材料、反应容器、管道,以及其他许多地方的材料,如燃料、润滑剂、洗涤剂、金属加工液使用。 当一个化学反应的腐蚀现象之间发生资料和周围介质。这就要求阴极和阳极地区对材料表面化学势他们之间的差异以及电荷转移机制。反应和地区可以依靠条件的介质,例如在pH值和存在的活化阴离子。 腐蚀抑制剂设计工作在几个方面,例如阻塞或阴极和阳极网站,或者清除激活离子。他们能够采取行动之前,他们必须被流放到材料表面,哪些地方限制他们的稳定性。他们必须将吸附在表面上如果成功,这就是他们的作用方式。这涉及到物理吸附和chemisorption这样的过程。通常,抑制剂必须建立厚厚的资料,哪些地方限制其体积性质。 所涉及的过程过于复杂,难以模型从第一原则。最好的方式来利用分子建模,以协助设计新的,好的缓蚀剂来封装知识如何执行现有抑制剂成一个结构与活性关系(SAR)和运用这一预测新结构的行为。最好的预测的结构,然后被调查的活动能在实验室里 三.介绍 在这一课中,你将会执行一些基本的步骤设计一种新型缓蚀阻垢剂。 这篇教程涵盖: *开始 *对于进口和验证了该结构和实验数据 *对正结构 *计算分子描述符的 *履行初始数据进行分析 *建立并验证了构效关系或模型 *添加atom-based描述符 *建立并验证新模型 *创建一个新的候选人缓蚀阻垢剂 *预测的压抑的候选人 注意。为了确保你可以追随这篇教程一模一样的本意,你应该使用这些设定组织者的对话框来确保所有你的项目设置为他们的Accelrys默认值。看到创建一个项目教程请示如何恢复缺省设置。 小费。本教程是最好的文件扩展名,进行与对每一份文档显示出来。如果文件扩展名是不显示在你的项目中,请参阅项目探险家探险家话题请示如何重新配置。 1。开始 开始,由开始的材料工作室,创造了一个新的项目。 开设新项目对话框并进入缓蚀阻垢剂的项目名称,点击OK按钮。 而创造出新的项目是缓蚀阻垢剂中列出的项目的探险家。 现在创建一个新的研究表文件。 选择文件|新……从菜单栏打开新的文件对话框。选择研究表,并点击OK按钮。 这项新研究表CI.std重命名的。 一项研究表可以被认为是主要的观点上的多个结构和评价模型,并将会被自动创建和管理在这个教程。 你将进口一个SD文件包含了结构和实验数据需要这教程。 选择“编辑|插入从…从菜单栏。浏览到例子\ \结构构象双击Corrosion.sd文件夹和文件。 Corrosion.sd文件包含的结构和实验数据为19个不同缓蚀剂分子。其结构被插入的第一列学习表。附加柱含结构的名字和阻垢缓蚀性能数据的进口的分子。在这个例子中,高价值的同时,更好的阻垢缓蚀性能的抑制剂执行。 2。对于进口和验证了该结构和实验数据 第一步,在验证性结构中研究表是肉眼检查他们并且设法把结构特征值对现在的阻垢缓蚀性能提供了参考。 双击结构腐蚀- 1 CI.std研究在桌子上。 这将打开一个文件视图研究表。 从选择窗口|瓦垂直的菜单栏。 这个安排开启的文件以这样一种方式,让你看到两者的结构和阻垢缓蚀性能研究专栏的桌子。 研究表和视图 在研究工具栏,点击表观众一步一步前进按钮视图通过抑制剂结构研究的CI.std列在桌子上。 如果你查看数据,你会看到有同源序列中,这一套化合物,用一个线性烃链长度的增加附加在tri-substituted氮原子。值得注意的是,这个系列的缓蚀作用是一种非线性函数中的油气,分子链的长度。 小费。如果结构几何结构上看不准确,你可以用Forcite或鞋面模型来优化研究中各种结构的桌子。 关闭CI视图。 抑制数据来验证了,你应该的分布进行调查,采集的数据。大多数回归算法依赖于数据,是被研究被态分布,所以如果你的数据不是态分布,你应该考虑应用数值变换来实现一个正态分布。材料工作室能够让您分析您的数据,以确定它是否可以被认为符合正态分布。 选择CI.std缓蚀作用和点击页眉、标记的C柱选择整个专栏。初步分析统计| |选择从菜单条的单变量分析。 一个新的文件叫做CI -单变量Analysis.xgd被显示出来。它包含一些统计,descr措施在缓蚀作用的数据研究专栏的词表。 单变量分析的一部分的抑制数据 标签在选择分布Analysis.xgd CI -单变量。 标签显示分布的百分比在每个统计数据。如果你比较一下这些价值观的百分比,会被发现在正态分布处理,你可以看到,除本8、9月的阻垢缓蚀性能数据接近正常的分布。