细菌的系统发育与基因组注释技术总结.pptxVIP

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2017-06-26 发布于湖北
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细菌的系统发育与基因组注释技术总结.pptx

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Acinetobacter baumanii ACICU的系统发育分析与全基因组注释;;系统发育树的介绍：;系统发育树的介绍：;系统发育树构建一般过程：;系统发育树的构建方法以及种类：;16S rRNA是所有原核生物蛋白质合成必需的1种核糖体RNA，其具有以下特点： 1.多拷贝。每个细菌含5～1O个16S rRNA拷贝，这使得检测敏感性较高。 2.多信息。16S rRNA基因内部结构由可变区和保守区组成。保守区为所有细菌所共有，可变区在不同细菌之间存在不同程度的差异，具有属或种的特异性，可变区与保守区交错排列。 3.长度适中。16S rRNA 编码基因长度1500bp，包含大约5O个功能域。 ;邻接法（neighbor-joining）:;;最大简约法（maximum parsimony method）;;2.基于全基因组的系统发育树的构建;2.基于全基因组的系统发育树的构建;基于序列短串含量特征信息的方法：;使用CVTree3.0构建系统发育树：;CVTree计算步骤：;3.A.baumanii 的全基因组注释;自定义页（可选）（设计好之后可以删掉这个文本框哦）