植物着丝粒.ppt

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植物着丝粒

植物着丝粒 着丝粒的概念 着丝粒(centromere):指中期染色单体相互联系在一起的特殊部位。 着丝点(kinetochore):指主缢痕处两个染色单体外侧表层部位的特殊结构,它与仿锤丝微管相接触。 着丝粒的概念 细胞学:着丝粒就是细胞分裂过程中染色体与纺锤丝(spindle fiber)结合的区域。 生物化学:如果一段DNA序列与着丝点相互作用,那么这段序列是功能着丝粒的一部分。 着丝粒 centromere 着丝粒的结构 着丝粒的超微结构 着丝粒含3个结构域,即:着丝点结构域(kinetochore domain)、中心结构域(central domain)和配对结构域(paring domain)。 着丝粒的功能 着丝粒的主要功能是在细胞分离时指导染色体配对和分离。 着丝粒的功能 着丝粒的功能 着丝粒特有组蛋白 在植物中,已知有14种论证了或阳性的着丝点蛋白,这些蛋白主要位于着丝点内和外面两处 。 着丝点外的着丝粒蛋白是在染色体分离时有用,而且是短暂的 。 着丝点内的着丝粒蛋白能够识辨着丝粒的DNA,和形成一种特别的染色质环境。 总之,在功能性着丝粒中线性的散布着CENH3-DNA结合序列和H3-DNA结合序列。所以可以说如果一段DNA序列与CENH3相结合,那么这段序列在着丝粒中。 着丝粒组蛋白类型 类型 功能 CENP-A 着丝粒特异性组蛋白 CENP-B 与中央结构域的卫星DNA结合 CENP-C 与着丝点结合 CENP-D 与着丝点结合 CENP-E 驱动蛋白类分子马达 CENP-F 与着丝点结合 INCENP-A 连接姊妹染色单体 INCENP-B 连接姊妹染色单体 着丝粒组蛋白位置 着丝粒组蛋白功能 着丝粒重复序列 着丝粒序列上存在大量的高度重复序列 ,使得对其的作图,克隆和测序都很难进行。 酵母的着丝粒由125bp左右的特异DNA序列构成。 人类每条染色体的着丝粒估计有3-4M长,主要是由富含AT长约171bp的重复序列组成(α-卫星)。 在高等植物的着丝粒估计由2-9Mb长,是由150-178bp长的卫星序列组成。 着丝粒重复序列类型 着丝粒的卫星序列 卫星序列最要是着丝粒DNA的主要组成部分。 着丝粒的卫星序列 在人类染色体着丝粒中是~171bp长的α-卫星重复序列组成的。 在拟南芥的功能性着丝粒中,含量最多的DNA元件是pAL1重复序列――是180bp卫星重复序列的家族,占整个拟南芥基因组序列的3%。 在水稻的着丝粒中也发现几种DNA重复序列,155 bp长的重复序列CentO是水稻中特有的。在细胞学中CentO卫星重复序列在水稻的着丝粒中存在。 着丝粒特有的反转座子 虽然大多数的反转座子家族在植物着丝粒中的含量较少,但是有一些反转座子在着丝粒区域中很多,而且是着丝粒特有的序列。 在草本植物中发现一种有趣的着丝粒转座子(CR)家族。 在水稻、玉米和黑麦的CR元件中的长末端重复序列(LTRs)有高度保守的片段。 水稻着丝粒的位置 水稻的着丝粒 水稻着丝粒中心区域是由长约155bp的卫星重复序列组成,在日本晴中一共有约7Mb长。 对水稻着丝粒的序列分析表明大多数着丝粒DNA元件是从Ty3/gypsy反转座子家族中进化过来。但是,155?bp长的重复序列CentO是水稻中特有的。 水稻的着丝粒 水稻着丝粒的CentO卫星重复序列 水稻着丝粒的CentO卫星重复序列 所有CentO序列单体是同一方向排列的,但是它们的组成是极其复杂的。 有两个明显的亚家族,一个是由155bp(252拷贝)组成,另一个是由164bp组成。 所有164bp单体两侧与155bp单体相连 。 水稻的着丝粒 水稻的反转座子 BAC 17p22 水稻第八号染色体着丝粒 White boxes represent the predicted genes. Green and gray boxes indicate the TEs. The names of TEs or TE-like sequences identical to those in GenBank as described in the text are shown above the corresponding sequences. Arrows represent LTR sequences and their orientations. Arched arrows indicate that the TE sequence is interrupted by DNA insertions. Red bars indicate elements containing sequences similar to the

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