MEGA5制作进化树教程.pptxVIP

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2017-06-25 发布于上海
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MEGA5制作进化树教程.pptx

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MEGA5制作进化树教程ppt课件

利用MEGA5制作蛋白质进化树;1：在NCBI中进行BLAST;2：将已知序列和blast得到的序列复制到txt文档中。注意格式如下“”+序列名称。保存并关闭文档，将文件重命名，将“.txt”改为“.fasta”。或者直接在NCBI上下载fasta格式的文件。;3：打开MEGA5，点击Align按钮，选择Edit/Build Alignment。;4：点击ok。;5：选择Protein。;6：弹出如下窗口。;7：按打开按钮。;8：打开刚刚保存的fasta文件，如下图。;9：按W按钮，进行Align Protein。;10：弹出如窗口，设置参数，这里选择默认，点击ok。;11：Align Protein之后的结果。;12：关闭Alignment Explorer 窗口，弹出如下是否保存对话框，选择“是”进行保存。;13：这里保存为test.mas。;14：点击File，选择Open A File/session…;15:打卡刚刚保存的mas文件，弹出如下对话框，选择Analyze。;16：点击Phylogeny，选择Construct/Test Neighbor-Joining Tree…。;17：弹出如下对话框，设置参数，这里???择默认，点击compute。;18：弹出窗口，为结果。