模式生物基因组研究揭示了人类疾病基因的功能.ppt

* 以酵母为例 首先它是一个单细胞，可以在特定的培养基上生长，这样就可能完全控制其化学和物理环境。 其次酵母的生命周期也很适合被用来作遗传分析，有可能构建一套16 条染色体单倍型的详尽的图谱。 第三，现今的技术可以将其6000 个基因中的任何一个用突变的等位基因替代或准确地从基因组中缺失。 * 模式生物基因组研究对人类基因组研究的促进作用 4 比较基因组作图在人类基因组研究中的应用。 应用之一是使连锁信息和基因组资源从作图较为详尽的物种转移到作图不完善的物种。例如：通过定位一套在哺乳动物中进化上保守的位点，把这些保守位点作为出发点，使连锁信息从人、鼠等物种扩展到牛、猪、羊等物种,以促进基因组研究。 * 模式生物基因组研究对人类基因组研究的促进作用 另一个应用是把比较基因组作图用于复杂性状的分析。许多遗传性状是由一个以上的基因控制的，这些基因的识别通常在老鼠中比在人中来得容易。一旦一个候选疾病基因或疾病区域被在老鼠中确认，我们就可以筛选同源基因或同源区域，看看是否与人类遗传病相对应。 * 模式生物基因组研究加深了对基因组结构的认识 人类的基因很大，在人类基因组全部测序完成之前，已有一些cDNA 上测序。所以其基因组结构可能尚属未知。 利用低等模式生物基因组较小、呈压缩状态，就可能用节约的方法在基因组水平上测序。展示基因组的结构，包括内含子和外显子的边界和周围顺序，还可能包括调节因子，如启动子和增强子。 不但为基因结构的研究，也为相关基因的进化提供了信息。 * 　利用模式生物基因组研究信息研究人类疾病基因的可行性 定位克隆是一项有效的疾病基因克隆的手段。但是如果仅仅依靠位置信息进行定位克隆，将十分费时费力。 比较生物学这个名词在许多文献中出现，模式生物基因组研究的结果被大量地用于人类基因组的研究，成为人类疾病基因克隆的一条捷径。 * 　结语 基因组研究的最终目的是希望对生命的本质有更新更深刻的认识，更主要的是了解疾病机制,造福人类。 模式生物在人类疾病研究领域作出了许多的贡献，特别是疾病基因的同源体或家族成员在模式生物中被功能定性时，使我们能更多地了解疾病基因。 基因组计划的成功正在越来越多、越来越深刻地影响着生物学各个领域研究者的思想,它为新世纪的生物学研究打开了一扇门。 * 比较基因组学 中英联合实验室 * 比较基因组学的产生 伴随着基因组的研究, 相关信息出现了爆炸性增长, 迫切需要对大量基因组数据进行处理, 比较基因组学作为一门重要的工具学科应运而生。 比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之间的全方位基因和基因家族的比较分析，构建系统发育的遗传图谱, 来揭示基因、基因家族的起源和功能及其在进化过程中复杂化和多样化的机制。 * 果蝇基因组 果蝇基因组全长180mb，2/3是 euchromatin，1/3是heterochromatin；Blast Search确定有14113个转录产物（功能基因）。?? Science, 287:2185-2195 (2000) * 比较基因组学定义 利用不同物种基因组之间功能区域顺序上、组织结构上的同源性 克隆新基因 揭示基因功能 阐明物种进化关系、基因组的内在结构 * 比较基因组学的应用 揭示非编码功能序列 发现新基因 发现功能性SNP 阐述物种间的进化史 阐明人类疾病过程的分子机制 * 比较基因组学与进化 古细菌---产甲烷球菌 与原核生物共同之处： 染色体组织与结构：环状基因组、基因的操纵子结构等 能量产生和固氮基因与有很高的同源性 与细胞分裂有关的蛋白质、20多个编码无机离子运输蛋白的ORF与细菌基因同源 调控模式类似于原核生物 与真核生物共同之处： 细胞遗传信息传递，尤其是转录和翻译系统 分泌系统 说明该细菌与真核生物亲缘关系较近。 * 比较基因组学与进化 比较基因组学提供的结果表明，在进化系统树上，古细菌与真核生物亲缘关系比原核生物更近。 自养生物的三个分支，细菌、古细菌和真核生物中，细菌的分化发生较早。 * 比较基因组学的具体应用方法和策略 序列的比对分析 确定基因组序列的进化关系 基因共线性synteny ： 染色体片段的分析 物种序列的优化选择 对DNA序列的信息注释 * 基因组成的相似性 基因共线性synteny：基因排列顺序的一致性 宏观共线性：遗传连锁图上锚定标记排列次序的一致性 微观共线性：物理图上基因序列的一致排列 进化距离非常近的物种间保持很好的微观共线性 在进化过程中，基因共线性