欧洲黑杨PnEXPA1基因多态性与稳定碳同位素比率的-林业科学研究.PDF

林业科学研究　２０１４，２７（３）：３４９ ３５５ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　文章编号：１００１１４９８（２０１４）０３０３４９０７ 欧洲黑杨ＰｎＥＸＰＡ１基因多态性与稳定碳同位素 比率的关联分析 张伟溪，褚延广，黄秦军，张冰玉，丁昌俊，苏晓华 （林木遗传育种国家重点实验室，中国林业科学研究院林业研究所，国家林业局林木培育重点实验室，北京　１０００９１） １３ 摘要：对欧洲黑杨 ｅｘｐａｎｓｉｎ基因ＰｎＥＸＰＡ１的ＳＮＰ多态性与水分利用效率相关性状稳定碳同位素比率（ Ｃ）进行 α δ 了关联分析。利用ＳＮａＰｓｈｏｔ技术对ＰｎＥＸＰＡ１基因内１１个ＳＮＰ位点进行了基因型分型，发现各ＳＮＰ位点优势基因 型均为纯合，且其频率高于杂合基因型。关联分析显示：ＳＮＰ８和ＳＮＰ１２在采用单因素方差分析（ＡＮＯＶＡ）和一般线 １３ 性模型（ＧＬＭ）２种方法时均与 Ｃ值显著关联。ＳＮＰ８为ｅｘｏｎ１内的无义突变，可解释６．６２０％的表型变异；而 δ ＳＮＰ１２位于ｉｎｔｒｏｎ１中，遗传贡献率为６．６１３％；这２个ＳＮＰ位点与ＳＮＰ９、ＳＮＰ１３共同位于一个高连锁不平衡（ＬＤ） １３ 的单倍型块中。ＳＮＰ８与ＳＮＰ１２的ＴＴ基因型无性系均具有较高的 Ｃ值，为优势基因型。 δ 关键词：欧洲黑杨；伸展蛋白基因；单核苷酸多态性；稳定碳同位素比率；关联分析 中图分类号：Ｓ７９２．１１９ 文献标识码：Ａ ＡｓｓｏｃｉａｔｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓｉｎＰｎＥＸＰＡ１Ｇｅｎｅｗｉｔｈ ＣａｒｂｏｎＩｓｏｔｏｐｅＲａｔｉｏｓｉｎＢｌａｃｋＰｏｐｌａｒ（ＰｏｐｕｌｕｓｎｉｇｒａＬ．） ＺＨＡＮＧＷｅｉｘｉ，ＣＨＵＹａｎｇｕａｎｇ，ＨＵＡＮＧＱｉｎｊｕｎ，ＺＨＡＮＧＢｉｎｇｙｕ，ＤＩＮＧＣｈａｎｇｊｕｎ，ＳＵＸｉａｏｈｕａ （ＳｔａｔｅＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＴｒｅｅＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＢｒｅｅｄｉｎｇ，ＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ， ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＴｒｅｅＢｒｅｅｄｉｎｇａｎｄＣｕｌｔｉｖａｔｉｏｎ，ＳｔａｔｅＦｏｒｅｓｔｒｙＡｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ，Ｂｅｉｊｉｎｇ　１０００９１，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｅａｕｔｈｏｒｓｒｅｐｏｒｔａｎａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓｔｕｄｙｏｆＳＮＰｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓｉｎａ ｅｘｐａｎｓｉｎｇｅｎｅＰｎＥＸＰＡ１ｗｉｔｈｓｔａｂｌｅ α １３ ｃａｒｂｏｎｉｓｏｔｏｐｅｒａｔｉｏｓ（ Ｃ）ｉｎＰｏｐｕｌｕｓｎｉｇｒａ．Ｉｎｔｏｔａｌ，１１ＳＮＰｌｏｃｉｗｅｒｅｇｅｎｏｔｙｐｅｄｗｉｔｈＳＮａＰｓｈｏｔｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ δ ｗｈｉｃｈｉｎｄｉｃａｔｅｓｔｈａｔｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓｇｅｎｏｔｙｐｅｉｓｍｏｒｅｃｏｍｍｏｎｌｙｏｃｕｒｒｅｄｆｏｒｅａｃｈｉｎｄｉｖｉｄｕｌｗｉｔｈｈｉｇｈｅｒａｌｌｅｌｅｆｒｅｑｕｅｎｃｙ． １３