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rapigest sf表面活性剂:用于溶液中酶蛋白消化的工具
RapiGest SF试剂:促进溶液中蛋白酶解的有利工具
Ying Qing Yu与Martin Gilar
美国马萨诸塞州米尔福德沃特世公司
简介
本应用纪要中,我们介绍了沃特世专利RapiGest? SF试剂的物理化学性质及其应用领域。2002年,我们首次推出RapiGest SF,这一创新产品是帮助酶消解的有利工具,可促进溶液中蛋白的消解,它能够改善样品制备过程中蛋白的溶解度。
RapiGest SF提高酶解速率与完全程度的机理详见图1。温和的蛋白变性可打开蛋白结构并暴露酶切位点,以供酶切。在RapiGest SF溶液中,酶对变性的耐受性优于普通蛋白,并能保持活性。在加入酶之前高温加热RapiGest SF溶液可使球蛋白更为完全变性,之后需将酶与样品一起进行37 °C的孵育。1,2
超过200多家行业内杂志引用了使用RapiGest SF进行样品溶解的案例,大部分为蛋白组学的应用。最近,许多制药实验室使用RapiGest SF用于蛋白药物的确证。因为酶消化的速度的提高并在LC、MS分析前极易清除,RapiGest SF已被多个应用领域广泛接受,其中包括高级序列研究的LC/UV/MS蛋白药物的肽图分析。
讨论
什么是RapiGest SF?
RapiGest SF是酸性不稳定表面活性剂,在酸性条件下极易水解。1这种独特的性质,在需要的时候,可用于从溶液中清除表面活性剂。RapiGest SF的结构及其水解副产物见图2。酸性不稳定的性质可在pH2条件下,45分钟内达到完全降解。1
该表面活性剂可降解为两个产物:dodeca-2-one和3-(2,3-)HPLC、LC/MS或MALDI-TOF MS进行分析。
消解后的清除
样品分析前无需额外去清除表面活性剂(如透析)。在分析前,酶消解后通常经过酸(如甲酸、三氟乙酸(TFA)(HCl)RapiGest SF。建议降解条件pH ≤ 2。
胰蛋白酶消解的兼容性
胰蛋白酶是最常见的蛋白水解酶,可用于肽图分析和蛋白组学的应用。我们研究了在添加RapiGest SF的情况下胰蛋白酶的活性作用,并与文献中最常见的变性剂的作用做了对比。本检测基于胰蛋白酶诱导N-α-苯甲酰-L-精氨酸乙基乙酯(BAEE)50 mM重碳酸胺(pH 7.9)UV 253 nm下测量BAEE水解率进行计算。在选择的变性溶液中,胰蛋白酶活性与对照样品进行对比(非变性剂)。结果见于表1。
表1中的数据说明低浓度下(0.1%) RapiGest SF
本实验说明蛋白酶的活性受到蛋白溶液中所用变性剂的影响。RapiGest SF在从低到高的浓度下均不改变酶活性,因此,最佳的蛋白消解条件是无需过量酶即可达到酶解的结果。
快速蛋白消解
对蛋白酶解存在抗性的蛋白使用RapiGest SF试剂,可在数分钟内消解完全。完全消解球蛋白、马肌红蛋白只需要5分钟内即可完成。该试剂辅助的消解结果与对照见图3。由于肌红蛋白是球蛋白,众所周知,若没有表面活性剂将难以消解。在对照反应中,与胰蛋白酶孵育9小时后只有少量的蛋白可以消化。使用了RapiGest SF试剂,总体的消解的效率显著提升。
在蛋白药物肽图中的序列覆盖范围更大
RapiGest SF在蛋白组学的样品前处理中广泛使用,是有效的蛋白溶解变性剂。最近越来越多的生物制药实验室在肽图分析中采用了RapiGest SF。一些发表的论文记录了使用RapiGest SF进行蛋白药物消解的优势。4,5经报导的RapiGest SF浓度范围为0.05 -1%,取决于蛋白疏水性与浓度。
我们发现浓度范围为0.05 -1%的RapiGest SF足以使各种大小的蛋白变性,高浓度RapiGest SF适合全细胞蛋白提取的实验。
单抗(mAbs)(PTMs)RapiGest SF辅助的人单抗消解的实例。样品制备与分析的参数以UPLC?和四级杆Tof质谱分析的参数已列表作为指导。
图4显示实验中总序列覆盖率为98%。数据分析通过BiopharmaLynx? v.1.2软件得到。高序列覆盖率(98%)LC/MS分析中没有发现错误酶切的多肽或完整未被酶切的蛋白。剩下的2%未确认的序列为少数二个氨基酸的肽或单个氨基酸(RK)
样品制备
人单抗样品(10 μL, 21 mg/mL)0.1% (w/v) RapiGest SF 50 μL 50 mM重碳酸铵中溶解。将2 μL 0.1 M的二流苏糖醇(DTT)50 °C加热30分钟,加入4 μL 0.1 M的碘代乙酰胺,在样品冷却至室温后样品在黑暗中静至40分钟。
人化单抗IgG多肽图谱
蛋白序列覆盖率= 98%
样品中加入8 μg胰蛋白酶(胰蛋白酶浓度= 1 μg/μL),样品在37 °C孵育过夜。消解样品与1%甲酸与10%乙腈混合(
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