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- 2017-06-29 发布于湖北
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CRISPRprocedure汇编
CRISPR流程设计靶组分并使用CRISPR设计工具 1d输入目标基因组DNA序列我们提供在线CRISPR设计工具() 可以输入序列(例如,来自目的区域的一个1KB基因片段),识别和排列合适的靶位点,计算预测每个指定靶标的off-target位点。或者,可以通过确认任何5’-NGG直接上游的20-bp序列手动选择引导序列。用在线工具确定,订购需要的oligos和引物。如果手动确定分裂位点,oligos或引物应该按照fig4b.c设计。设计ssODN模板(任选) 1h设计和订购定做的ssODN。购买直接来自IDT或首选供应商的正义或反义ssODN的其中一个。我们推荐手动设计每侧至少40nt的同源臂,90nt可以得到最佳HDR效率。PAGE纯化ssODN不是必要的。重新溶解和稀释ssODN ultramers到终浓度10uM。不要使正义和反义ssODNs结合或退火。储存在-20°。准备sgRNA表达结构为了构建sgRNA表达结构,使用PCR表达cassette(选项A)或以质粒为基础的步骤(选项B)通过PCR扩增构建sgRNA表达结构 2h(i)准备稀释的U6 PCR模板。我们推荐使用pSpCas9(BB)或pSpCas9n(BB)(spl.2)作为PCR模板,但任何包含U6的质粒都可以使用。用ddH2O稀释模板到10ng/ul。注意,如果一个质粒或cassette已经包含一个U6驱动
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