蛋白质组与代谢组.pptx

苯并(а)芘对马氏珠母贝毒学效应的代谢组和蛋白组的分析 院 系 水产学院 专 业 海洋生物学 学 号 2111501003 姓 名 雷 超 、 目录 前言 材料与方法 结果与讨论 结论 3 4 5 收获 前言 多环芳烃（多环芳烃）是海洋环境中普遍存在的污染物。在海洋环境中多环芳烃的污染可以来自三个主要来源，包括成岩作用、石油高温热解和火山喷发。 BaP是一种5环多环芳香烃，由于对细胞的毒性，对细胞的诱导及致癌的性质，让其成为研究最多的多环芳香烃之一。 有文献报道BaP会损伤DNA，影响芳烃受体，核蛋白，细胞色素。 BaP 能够改变多种外源性代谢物，主要是二醇环氧化合物。 前言——研究现状 前言——方法对比 传统的毒理学方法 注重普通分子标记 1.抗氧化酶的活性 2特殊基因的表达 缺乏灵敏性和特异性 蛋白质组学和代谢组学 蛋白质组学 1.可以描述细胞器，细胞，器官，组织水平的蛋白。 2.比较各种环境压力之下的蛋白。 代谢组 揭示代谢反应 前言——研究意义 双壳类通常作为海洋污染的生物指示种。马氏珠母贝由于其较低的代谢效率和滤食的习性很容易积累海洋中的有害化学物质。因此，将其作为一种新型的海洋污染指示生物体。目前，很少有文献报道，由于BaP的诱导，马氏珠母贝在蛋白质组学和代谢组学水平上的反应机制。本文献整体报道了用蛋白质 组学和代谢组学来阐明BaP对马氏珠母贝的毒理学效应。 材料与方法 实验设计 高浓度的BaP 1.材料处理 处理条件：盐度32‰，pH=8.2±0.1，27 ± 1 ◦C 2.实验设计 材料与方法 蛋白质与代谢物的抽提 2DE的图像获取和数据分析 胶内酶切和质谱分析 1H NMR光谱和光谱预处理以及 多变量数据分析 结果与讨论 BaP对马氏珠母贝肝胰腺的蛋白质影响 结果与讨论 1.对照组与单一溶剂对照组的蛋白点没有明显差别。 2. 单一溶剂组与高低浓度的BaP组之间共鉴别出28个差异蛋白，其中9个上调，19个下调。 3.大部分差异蛋白集中在高浓度组的的BaP，这些差异蛋白的主要功能主要在以下几方面：细胞骨架，细胞损伤，氧化应激，信号转导，能量代谢。 4.差异显著地2种蛋白分别是组织蛋白酶L和蛋白酶体。 结果与讨论 5.SHSP和DNAJB11表达量下降表明高浓度的BaP可能使细胞损伤或是凋亡。相反，低浓度的BaP诱导细胞产生免疫反应。 6.天冬氨酸转移酶的表达量在高浓度的BaP的环境下上调5倍。说明BaP改变了天冬氨酸在贝类肝胰腺的代谢平衡。 结论： BaP诱导了一些蛋白的改变，干扰了贝体了能量分配和物质代谢平衡。 BaP对马氏珠母贝肝胰腺的代谢组的的影响 1.异亮氨酸 2.亮氨酸 3.缬氨酸 4.苏氨酸 5.丙氨酸 6.精氨酸 7.谷氨酸，8谷氨酰胺 9.乙酰 10.琥珀酸 11.β-丙氨酸 12亚牛磺酸 13天门冬氨酸 14.二甲基甘氨酸 15.丙二酸盐，16胆碱 17磷酸胆碱 18牛磺酸 19.甘氨酸，20.甜菜碱 21龙虾肌碱，22葡萄糖，23糖原，24 ATP，25酪氨酸，26.苯丙氨酸 27 NADP +。 结果与讨论 高浓度的BaP改变了贝类肝胰腺的代谢产物。各种氨基酸，有机渗透物质，乙二酸盐，乙酰乙酸盐显著减少。相反地，磷酸胆碱，甘氨酸和NADP+均显着增加。低浓度的BaP没有引起贝类明显的新陈代谢的变化。由于NMR 的灵敏度小于质谱的，低浓度的BaP可能引起的代谢变化太小以至于NMR没有检测出来。 结论 差异蛋白主要涉及蛋白质的降解，应激反应，免疫反应。有变化的代谢物主要涉及在柠檬酸循环，尿素循环和糖酵解。 尤其，一些特有的和有显著差异性的代谢生物标记（支链氨基酸，苏氨酸，丙氨酸，谷氨酸盐，亚牛磺酸，二甲基，丙二酸盐，乙酰乙酸酯，磷酸胆碱和甘氨酸）表明BaP可能很大程度上影响了渗透调节及能量代谢。一些蛋白质组生物标志物中涉及的不同反应，包括能量和初级代谢，细胞骨架，防御，细胞凋亡和信号转导。 收获 通过对本文献的学习，收获良多。 1. 对实验思路的学习。 2.对分子标记的理解。 3.对质谱，核磁共振有进一步的了解。