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Ensembl？ サイエンス?テクノロジー?システムズ株式会社 癸生川絵里 Web-Interface 多彩なView 導入事例　ご紹介 Architecture Database Database API 利用 API 直利用 Happy, Ensembling ! ;) * What’s Ensembl？ EMBL-EBIとSangerCenterのジョイントプロジェクト 　 　　 公共データバンクからDNAデータを収集 　　 アセンブル 　　 アノテーション付加　　　　　　　　　　　　　　　 　 “Free Unrestricted Genome Access For All” 　　　（得られるゲノム情報は専用インターフェース等を含めフリーで提供している。） 　　 オープンソースソフトウェアとして特に以下が利用可能。 Web-Interface Database API ( Java, Perl ) ローカルに環境構築可能。 カスタマイズ可能。 Automaticに行うシステムを 開発、更新している。 Top page Help Desk（重要） ＆Documents（重要） Ensembl　Tour （Ensembl紹介） 　alignview 　anchorview 　blastview 　chromoview 　contigview 　cytoview 　dasconfview 　diseaseview 　domainview 　dotterview 　exonview 　exportview 　primerview 　protview 　snpview 　syntenyview 　tagloview 　transview 　mapview 　martview 　textview 　fastaview familyview 　genesnpview 　geneview 　goview 　haplomapview 　haploview 　helpview 　karyoview 　markerview 　multicontigview などなどございます。是非ご探訪ください。 情報?システム研究機構国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター 系統情報研究室　様 （ご内容） ■ Ensembl カスタマイズインストール 　- DASでインハウスデータを統合表示 　- データ作成 　- View編集 ■ データ更新 ＜事例1＞ ＜事例2＞ 　○×△　株式会社様 　（ご内容） ■ Ensembl Powered カスタマイズインストール Ensembl DBへ直接インハウスデータ 　を追加して統合表示 View編集 MySQL RDBMS Apache / mod_perl web servers Web code Ensembl API Bioperl browsers Ensembl DBs Schemas（MySQL） ローカルサーバ、外部公開サーバの Ensemblデータベースに接続させることが できます。 欲しい情報をまとめて抽出し、 他プログラムと連携させることができます。 サイエンス?テクノロジー?システムズ(株) http://www.st-systems.co.jp スライドショー中に画をダブルクリック。 スライドショー中に画をダブルクリック。 スライドショー中に画をダブルクリック。 * * *