生物芯片微阵列图像倾斜校正算法研究 - 中南大学学报.PDFVIP

第 45卷第 4期 中南大学学报(自然科学版)  Vol.45  No.4  2014 年 4 月  Journal of Central South University (Science and Technology)  Apr. 2014  生物芯片微阵列图像倾斜校正算法研究 吴灶全，陈熹，娄艳阳，陈杰，刘正春  (中南大学 地球科学与信息物理学院，生物医学工程研究所，湖南 长沙，410083)  摘要：针对现有生物芯片图像倾斜校正算法校正精度和运算速度的矛盾问题，提出对矩形样点和圆形样点图像分 别采用改进的 Hough 变换和改进的 Radon 变换方法进行倾斜校正。改进的 Hough 变换首先对图像进行二值化， 并仅统计矩形样点的上下边缘像素的 Hough 参数和累计值，然后根据所得的 Hough 参数空间提取占主导的直线 组，最终计算出直线组的平均倾斜角度；改进的Radon 变换在提取圆形样点边缘后，对边缘图像进行二级 Radon  变换，从而得到最佳校正角度。实验证明本文的方法能准确、快速地实现芯片图像的倾斜校正，为生物芯片样点 识别奠定基础。 关键词：生物芯片；倾斜校正；样点识别；  Hough 变换；Radon 变换 中图分类号：TP317.4  文献标志码：A  文章编号：1672−7207(2014)04−1091−07  Research of incline correction algorithm in microarray image  WU Zaoquan, CHEN Xi, LOU Yanyang,CHEN Jie, LIU Zhengchun  (Institute of Biomedical Engineering, School of Geosciences and Info­Physics, Central South University, Changsha 410083, China)  Abstract: Considering the contradiction between analysis precision and analysis speed of the now­being image incline  correction methods, novel algorithms based on modified Hough transform and Radon transform were proposed to deal  with deflected microarray images consisting of rectangular and circular  spots, respectively. After binaryzation of  a  deflected microarray image, the modified Hough transform was applied to a set of pixels lying in the upper and lower  edges of every rectangular spot. The dominant straight lines were obtained according to the Hough parameters and the  incline angle was then calculated in accordance with the average slope of lines. The modified Radon transform was  applied to extract the edges of circular spots and two­stage Radon transform was performed on the obtained edges to  generate