深圳地区HEV流行基因型及动物宿主带毒状况分析.pdfVIP

1682 实用预防医学 2007年 12月 第14卷 第6期 Practical Preventive Medicine，Dec．2007，Vol 14。No ． 6 文章编号：1006—3110(2007)06—1682—04 【论 著 】 深圳地区HEV流行基因型 及动物宿主带毒状况分析 何继宝 ，陈传德 ，郑泽璇。，何 清 ，柯昌文。 摘要： 目的 了解深圳地区戊型肝炎病毒(HEV)流行基因型及动物宿主带毒状况。 方法 通过同源比对 HEV四种基因型的戊型肝炎病毒序列，选取其保守序列部分设计两对巢式聚合酶链式反应的简并引物，建立一种可同时 扩增戊型肝炎四个基因型病毒RNA的PCR快速检测方法。对深圳市采集的80份猪粪便标本和6份戊型肝炎病人血清， 提取病毒RNA，然后进行 PCR检测，阳性时对扩增片段进行基因序列测定，并进行基因型分析。 结果 80份猪粪便标 本5份HEV—RNA阳性，6份病人血清样本中4份阳性。序列分析显示全部为HEV基因IV型，5份猪标本中的HEV基 因序列与GenBank中人 HEV的基因序列最相似，同源性为88％～94％。 结论 深圳地区HEV流行株为基因IV型， 而且猪HEV基因序列与人HEV之间有着高度的相似性，证实猪是 HEV的宿主，戊型肝炎是一种人兽共患传染病。 关键词： 戊型肝炎病毒(HEV)；PCR；基因型分析 中图分类号：R51 文献标识码：A Phylogenetic Analysis on Hepatitis E Virus(HEV)of Human and Animal Hosts From Shenzhen HE Ji—bao，CHEN Chuan — de，ZHENGZe—xuan，et a1．(LuohuDistrictCenterforDiseaseControl andPrevention，Shmz~n 518020，Guangdong) Abstract： 0bjective To investigate genotyping of HEV in Shenzhen． Methods Two pairs of consensus primers were designed according to the conserved sequence region of four—genotypic HEV strains for nested PCR．Eighty swine fecal specimens and 6 serum specimens frOm patients with HEV were collected for investigation in Shenzhen．HEV—RNA was de - tected by nested PCR．And positive PCR products were sequenced and analyzed phyIogeneticaIIy with neighbor—joining method． Results HEV—RNA was detected in 5 of the 80 swine feces specimens and 4 of the 6 human serum specimens． Sequence analysis showed that all of the positive isolates were genotype IV． Conclusions HEV