枣抑制消减cDNA文库构建与分析.PDF

第34 卷 第4 期 经 济 林 研 究 Vol. 34 No.4 2016 年12 月 Nonwood Forest Research Dec. 2016 Doi:10.14067/ki.1003-8981.2016.04.004 http: // 枣抑制消减cDNA文库构建与分析 1 2 2 2 1 魏琦琦 ，段经华 ，冯延芝 ，李芳东 ，张 琳 （1. 中南林业科技大学a. 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室；b. 经济林培育与保护省部共建教育部重点 实验室；c. 经济林培育与利用湖南省2011 协同创新中心，湖南 长沙 410004 ；2. 中国林业科学研究院 经济林 研究开发中心，河南 郑州 450003 ） 摘 要：枣树具有独特的开花结果特性，为获得枣花发育基因，以金丝4 号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶 片cDNA 互为试验方和驱动方，利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA 文库（SSH 文库）。枣花和枣叶SSH 文库重组率分别是92.05% 和90.26%，插入片段长度均介于200 ～2 000 bp 之间，主 要集中于1 000 bp 左右。分别从枣花和枣叶SSH 文库中随机挑选1 000 个阳性克隆进行DNA 测序、组装拼接， 结果显示枣花SSH 文库中获得96 条unigene ，其中contigs 43 个，singletons 53 个，96 条unigene 预测得到73 个 ORF，经过同源比对分析获得有注释的序列20 条，按功能分为7 类；枣叶SSH 文库中获得86 条unigene ，其中 contigs 45 个，singletons 41 个，86 条unigene 预测得到70 个ORF，经过同源比对分析获得有23 条注释的序列， 按功能分为6 类。 关键词：枣；抑制消减杂交；cDNA 文库；生物信息学分析；功能注释 中图分类号：S665.1 文献标志码：A 文章编号：1003—8981(2016)04—0020—05 Construction and analysis of suppression subtractive cDNA library in Chinese date (Ziziphus jujube) 1 2 2 2 1 WEI Qi-qi , DUAN Jing-hua , FENG Yan-zhi , Li Fang-dong , ZHANG Lin (1. a. The Key Lab of Non-wood Forest Products of State Forestry Administration; b. The Key Lab of Cultivation and Protection for Non-Wood Forest Trees of Education Ministry; c. 2011 Cooperative Innovation Center of Cultivation and Utilization for Non