枣抑制消减cDNA文库构建与分析.PDF

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枣抑制消减cDNA文库构建与分析

第34 卷 第4 期 经 济 林 研 究 Vol. 34 No.4 2016 年12 月 Nonwood Forest Research Dec. 2016 Doi:10.14067/ki.1003-8981.2016.04.004 http: // 枣抑制消减cDNA文库构建与分析 1 2 2 2 1 魏琦琦 ,段经华 ,冯延芝 ,李芳东 ,张 琳 (1. 中南林业科技大学a. 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室;b. 经济林培育与保护省部共建教育部重点 实验室;c. 经济林培育与利用湖南省2011 协同创新中心,湖南 长沙 410004 ;2. 中国林业科学研究院 经济林 研究开发中心,河南 郑州 450003 ) 摘 要:枣树具有独特的开花结果特性,为获得枣花发育基因,以金丝4 号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶 片cDNA 互为试验方和驱动方,利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA 文库(SSH 文库)。枣花和枣叶SSH 文库重组率分别是92.05% 和90.26%,插入片段长度均介于200 ~2 000 bp 之间,主 要集中于1 000 bp 左右。分别从枣花和枣叶SSH 文库中随机挑选1 000 个阳性克隆进行DNA 测序、组装拼接, 结果显示枣花SSH 文库中获得96 条unigene ,其中contigs 43 个,singletons 53 个,96 条unigene 预测得到73 个 ORF,经过同源比对分析获得有注释的序列20 条,按功能分为7 类;枣叶SSH 文库中获得86 条unigene ,其中 contigs 45 个,singletons 41 个,86 条unigene 预测得到70 个ORF,经过同源比对分析获得有23 条注释的序列, 按功能分为6 类。 关键词:枣;抑制消减杂交;cDNA 文库;生物信息学分析;功能注释 中图分类号:S665.1 文献标志码:A 文章编号:1003—8981(2016)04—0020—05 Construction and analysis of suppression subtractive cDNA library in Chinese date (Ziziphus jujube) 1 2 2 2 1 WEI Qi-qi , DUAN Jing-hua , FENG Yan-zhi , Li Fang-dong , ZHANG Lin (1. a. The Key Lab of Non-wood Forest Products of State Forestry Administration; b. The Key Lab of Cultivation and Protection for Non-Wood Forest Trees of Education Ministry; c. 2011 Cooperative Innovation Center of Cultivation and Utilization for Non

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