计算机辅助SARS冠状病毒主蛋白酶抑制剂的设计和高致病性禽流感病毒（H5N1）高抗药性研究.pdfVIP

天津师范火掌硕十研究’F汜正 中文摘要 用冠状病毒基因解析软件系统ZCURVE—CoV1．0和ZCURVE．CoV2．0分析 了基因数据库中的27个不同来源的SARS冠状病毒RNA基因序列，找出了主 蛋白酶(CoV 11个含有SARS冠状病毒主蛋白酶(SARSCoVMp”)真实剪切点位的八肽．计 算了口_『剪切八肽在特异性位点R2、R．、和Rt上的氨基酸分布概率．通过分予叠 合分析了这些位点上的氨基酸的结构特征，通过对接计算找出了最有希望成为 SARS CoV l AIAS-COOH和 M”多肽类抑制剂的两个八肽：Nh2一ATLQ l AENV-COOH．在“变形钥匙”理论的基础上，对其中一个八肽进 NH2-ATLQ 行了模拟修饰，得到了3个新的抑制剂，并通过计算对新抑制剂的活性进行了预 测． acid)复合物的晶体结构(PDB代码：1F8B)为模版，建立了H5NINA的同源 模型．根据同源模型提供的信息，结合相关的构效关系研究，阐明了H5N1流感 病毒的具有高抗药性的原因．研究发现H5N1NA中的活性位点是高度保守的．但 是，在H5N1 NA 中变成，亲水性口袋．此外，H5N1 性口袋．这些改变使NA中的亲水疏水环境发生变化，影响了NA与DANA问 的亲水疏水相互作用．这可能就是H5Nt对许多现有的NA抑制剂具有抗药性的 原因． 氨酸酶．抗药性，构效关系 查鲨壁鎏查兰型!之型!!竺堡=!!； Abstract inthe The softwareZCURVE—CoV2．0 isused ofSARS newlydeveloped analysis and 27 SARScoronavirus coronavirus the genomesrecognitionofproteincodinggenescomplete NCBIare fromdifferentsourcesin bank ZCURVE—CoV2．0，and genomes gene analyzedusing total297 ofSARSCoVMp”arefoundin and of27 cleavagepoints polyproteinsppla pplab amino cleavable SARScoronavirus．WecalculatethestatisticaldistributionsOf acidsof onthe structural ofamino octapeptidescleavage—specificpositionsR2，Ri，andRi，The properties acidresiduesonthe are flexiblemolecular cleavage·specificpositionsdiscussed,by alignments． Twobest and aresel