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第01章蛋白质的结构与功能概要1
疯牛病是由朊病毒蛋白(prion protein, PrP)引起的一组人和动物神经退行性病变。 正常的PrP富含α-螺旋,称为PrPc。 PrPc在某种未知蛋白质的作用下可转变成全为β-折叠的PrPsc,从而致病。 PrPc α-螺旋 PrPsc β-折叠 正常 疯牛病 疯牛病中的蛋白质构象改变 第四节 蛋白质的理化性质 The Physical and Chemical Characters of Protein 一、蛋白质具有两性电离的性质 蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团。 当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。 蛋白质的等电点( isoelectric point, pI) 二、蛋白质具有胶体性质 蛋白质属于生物大分子之一,分子量可自1万至100万之巨,其分子的直径可达1~100nm,为胶粒范围之内。 表面同种电荷 水化膜 蛋白质胶体的稳定因素: + + + + + + + 带正电荷的蛋白质 - - - - - - - - 带负电荷的蛋白质 在等电点的蛋白质 水化膜 + + + + + + + + 带正电荷的蛋白质 - - - - - - - - 带负电荷的蛋白质 不稳定的蛋白质颗粒 酸 碱 酸 碱 酸 碱 脱水作用 脱水作用 脱水作用 溶液中蛋白质的聚沉 三、蛋白质空间结构破坏而引起变性 在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。 蛋白质的变性(denaturation) 造成变性的因素: 如加热、乙醇等有机溶剂、强酸、强碱、重金属离子及生物碱试剂等 。 变性的本质: ——破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白质的一级结构。 应用举例: 临床医学上,变性因素常被应用来消毒及灭菌。 此外, 防止蛋白质变性也是有效保存蛋白质制剂(如疫苗等)的必要条件。 若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性(renaturation) 。 (一)二级结构的基础—肽单元(peptide unit) 对肽单元的说明: 肽键反式构型 肽键键长0.132nm <0.149 nm 0.127 nm < 部分双键性质,不能自由旋转。 参与组成肽键的C?1、C、O、N、H、C?2 6个原子在同一平面,称为肽键平面。 蛋白质二级结构的主要形式: ?-螺旋 ( ? -helix ) ?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ?-转角 ( ?-turn ) 无规卷曲 ( random coil ) ①外观:右手螺旋(顺) ?-螺旋结构要点: 1、?-螺旋 ( ? -helix ) ②螺距:3.6个氨基酸、0.54nm ③稳定因素:氢键 ④R基团的位置:螺旋外侧, R基团影响?-螺旋的形成 ①肽段折纸状、锯齿状,相对伸展。 ?-折叠结构要点: 2、?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ②几个肽段顺向平行、反向平行 ③维持因素:氢键。 ④R基团的位置:锯齿的上下方(外侧)。 4个氨基酸残基 第二个常为脯氨酸 180?回折 氢键维持 3. ?-转角 4. 无规卷曲 无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。 二个或二个以上二级结构 空间上靠近 特殊的构象 特殊的功能 (五)模体(motif)或超二级结构 定义 举例 (六)氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响 蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成?-螺旋或β-折叠,它就会出现相应的二级结构。 ⑴ 酸性或碱性AA集中的区域(同种电荷的相斥); ⑵ 脯氨酸,不利于α-螺旋形成(亚氨基酸); ⑶ 较大的R侧链集中,不利于α-螺旋形成 (空间位阻效应)。 影响α-螺旋稳定的因素: 三、蛋白质的三级结构(tertiary structure) 疏水键、离子键、氢键、 范德华力等。 整条肽链 全部氨基酸 所有原子 (一)什么是? 主要靠次级键: 三维空间的位置排布 此外还有共价键:二硫键 N 端 C端 肌红蛋白 (Mb) 30k 40k 20k 75k 60k 35k 30k H2N- COOH A H2N- COOH B 肝素 纤维蛋白 肌动蛋白 细胞 胶原蛋白 纤维蛋白 肝素 纤维蛋白 (二)结构域(domain) 纤连蛋白分子的结构域 举例 结构域: 三级结构中分割成折叠较为紧密的区域,各行使其功能。 分子
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