融合生物网络拓扑特性的肿瘤放疗敏感基因信号识别方法.pdfVIP

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2017-07-10 发布于北京
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融合生物网络拓扑特性的肿瘤放疗敏感基因信号识别方法.pdf

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第29 卷第 12期模式识别与人工智能 Vol.29 No.12 2016年12月 PRAI Dec. 2016 融融合生物网络拓扑特性的 * 肿瘤放疗敏感基因信号识别方法 ,2 3 时明王红强孙婷婷谢新平 1( 国科学院合肥智能机械研究所生物分子信息系统实验室合肥230031) 2(武汉学测绘遥感信息工程国家重点实验室武汉 430079) 3(安徽建筑学理学院合肥230031) 摘要肿瘤病人的辐射敏感性预测对于肿瘤的治愈具有重要意义.基于上述原因,文提出融合生物网络拓扑特性的肿瘤放疗敏感基因信号识别方法.首先基于基因表达谱和肿瘤样本SF2存活之间的Spearman相关系 , 初步估算每基因的辐射敏感度.然后根据目前已知的基因网络和蛋白质互作网络等生物网络的拓扑性质,利用随机行走算法进行校正.最后筛选辐射敏感基因,并以此为特征训练肿瘤样本 SVM分类器.实验表明文方法比现有常用的线性回归法和微阵列据显著性分析法加有效,识别的辐射敏感基因有利于临床肿瘤性化放疗的施行. 关键词辐射敏感性,组学据,生物网络,辐射敏感基因中图法分类号 TP391 DOI:10.16451/ki.iss201612001 引用格式时明,王红强,孙婷婷,谢新平.融合生物网络拓扑特性的肿瘤放疗敏感基因信号识别方法.模式识别与人工智能,2016,29(12):1057 1064. IdentificationofRadiosensitivityGeneSignatures BasedonTranscriptomicDataandBiologicalNetwork 12 2 2 3 SHIMing ,WANGHongqiang ,SUNTingting ,XIEXinping 1(MachineIntelligenceComputationalBiologyLaboratory,InstituteofIntelligentMachines, ChineseAcademyofS