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构建了乌达分子的遗传图谱
分子遗传图谱的构建;基于形态标记的果蝇经典遗传图谱;基于DNA分子标记的水稻分子遗传图谱;一、DNA分子标记及其检测技术;二、分子遗传图谱的构建;2、遗传图谱构建的主要步骤:
1、构建分离群体
暂时性群体(tentative population):F2、BC
永久性群体(permanent population):DH、RIL
2、筛选多态性标记
3、分离群体标记基因型数据的收集
4、利用作图软件(MAPMAKER/EXP等)构建遗传图谱;实例:水稻分子遗传图谱的构建;2、筛选多态性标记(以SSR标记为例) 群体标记基因型检测(PCR扩增及电泳检测) SSR标记的检测原理:如 ——(ATT)n—— ;3、分离群体的标记基因型数据的收集:RIL marker data.xls4、制作输入文件: 如ricemap.raw 5、运行作图软件MAPMAKER/EXP,构建遗传图谱 软件使用说明文件:MapMaker-EXP 3_0 Manual.htm (注: MAPMAKER/EXP只能安装在C盘才能运行);MAPMAKER/EXP的常用命令;6、triple error detection on:triple error detection is on.
7、 make chromosome chrom1 chrom2 chrom3 chrom4 chrom5 chrom6:
to define chrom1 chrom2 chrom3 chrom4 chrom5 chrom6
8、 make chromosome chrom7 chrom8 chrom9 chrom10 chrom11 chrom12
9、sequence 4 9: to tell which loci we wish to consider;10、anchor chrom1:to assign marker 4 and 9 to chromosome 1
11、sequence chrom1
12、two point
13 、frame chrom chrom1
14、draw chrom chrom1
15 、making an initialization file named (in this case) “ricemap.pre”
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