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药物的分子设计策略.ppt
下周自学内容: Youssef L. Bennani: Drug discovery in the next decade: innovation needed ASAP, Drug Discovery Today, 2012, 17S: S31-S44. 第四章 药物的分子设计策略(1) 一、药物研发的现状 产 品 格 局 世界前10强制药公司畅销品种分布 国产畅销药10强销售额分布 问 题: a.??盲目性大,活性不能被预测。 b.??寻找比现有药物更优秀的药物己日渐困难。 c.?疾病种类不断增多,而对新出现的疾病的本质认识不足。 d.??对新药的有效性和安全性的要求越来越高。 二、药物分子设计 理想的药物 * 特异的药效学 *良好的物化性质、合理的药代动力学 * 尽可能低的不良反应 创制新药的四要素 靶点的确定 模型的建立 先导物的发现 先导物的优化 药物分子设计 以理性的策略和科学的规划,构建具有预期药理活性的新化学实体 方法:天然产物、虚拟筛选、QSAR等 分子结构的多样性、互补性和相似性,是药物分子设计的策略基础 1. 分子的多样性 分子的多样性是发现先导化合物的物质基础 天然活性物质: 次级代谢产物结构的新颖性 组合化学合成: 多组份反应和骨架的多样性 组合生物合成: 用基因克隆方法合成非天然的 天然产物 组合生物催化: 在温和条件下对天然产物的多 元衍生化-功能基转化 随机筛选: 法人化合物库的高通量筛选 1).天然活性物质 动物、植物、微生物和海洋生物的多样性,决定了天然产物的结构多样性 生活在极端条件下的生物,产生独特结构的次生代谢产物 天然活性物质作为次级代谢产物,是为自身的防御和种群繁衍而产生的 天然活性产物是良好的先导物,但本身未必是药物 Small Molecule New Chemical Entities 01/1981-10/2008, By Source (N =1024) 天然产物的结构改造 以天然活性成分为先导物,经结构改造以优化活性和(或)药代,是非常活跃的领域 紫杉醇 喜树碱 大环内酯 青蒿素 Marizomib β-内酯-γ-内酰胺 他克莫司(免疫抑制剂和促神经生长) β内酰胺类抗生素 微生物来源--桔青霉菌的代谢产物 动物来源--九肽替普罗肽(Teprotide)从巴西毒蛇的毒液中分离得到 2).经典方法 b.代谢产物中发现 c. 临床药物的副作用 2) 组 合 化 学 组合化学,突破了传统的逐一合成和评价的研究模式,快速产生具有结构多样性的化合物库。 该新型合成策略和高通量筛选技术相整合 有机小分子化合物库为研究的主导方向 从过去随机制备组合化合物库转为目标化合物库,提高了效率和多样性 与基于受体结构的药物设计相结合的模式。 与虚拟筛选(virtual screening)接轨。提高入围化合物(hits)的质量 3).组合生物合成 原理:基因重组并克隆到不同生物体内→新酶系→新代谢产物 整合了基因重组技术与组合化学策略,将产生次级代谢产物的酶系编码的基因克隆到微生物细胞中,使产生多样的非天然的天然物质,实现分子的多样性。 聚酮是一大类生物活性物质,大多是由放线菌或真菌产生的代谢产物。 在结构上分:大环内酯、多环芳香酮 由小分子脂肪酸如乙酸、丙酸和丙二酸等经酶促Claisen缩合、还原、脱水、环合等反应而生成。 通过遗传操作,将聚酮合酶编码的基因,以组合的方式(混合、匹配或交换)克隆到微生物细胞中。 用组合方式,将红霉素A的基因发生多处变异,重组到微生物中,得到上百个6-deoxuerythronolide B类似物,超过了天然存在的大环内酯数目(McDaniel RM, Thamchaipenet A, Gustafsson C et al. Proc Nat Acad Sci USA 1999, 96: 1846-1851)。 4).组合生物催化 cDNA 2. 分子的互补性 分子识别是生物体实现特定功能的基本过程,在生命现象和药物作用中起中心作用 分子识别是受体与配体(底物,药物)选择性结合并产生特定功能的过程,是在超分子水平上进行信息处理的基础 分子识别是受体-配体结合的原动力,分子间互补性是识别之基础。互补性包括立体形状、静电作用、氢键形成、疏水相互作用。互补结合导致系统能量的下降
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