碱基的性质51 核苷酸的结构u g a 51 核苷酸的结构.pptVIP

双螺旋稳定的因素 （1）氢键 氢键固然重要，但主要决定碱基配对的特异性，对双螺旋稳定的贡献不是最重要的，起决定性作用的是碱基堆集力。 （2）碱基堆集力 这是碱基对之间在垂直方向上的相互作用所产生的力。它包括疏水作用和范德华力。碱基间相互作用的强度与相邻碱基之间环重叠的面积成正比。总的趋势是嘌呤与嘌呤之间嘌呤与嘧啶之间嘧啶与嘧啶之间。另外碱基的甲基化能提高碱基的堆积力。 （3）阳离子或带正电荷的化合物对磷酸基团的中和。 5’ 5’ 3’ 3’ 5.5 DNA的结构特征 5 核酸化学 5.6 A-型、Z-型DNA结构特征 A型双螺旋、B型双螺旋和Z型双螺旋的比较 5.6 A-型、Z-型DNA结构特征 由Alex Rich发现 存在于DNA富含G:C的区域，磷酸核糖骨架呈Z字形展开； 人工合成GC交替序列，X射线晶体衍射发现； 5-甲基胞嘧啶有利于Z-DNA形成； 影响基因表达。 Z-DNA 5.6 A-型、Z-型DNA结构特征 5 核酸化学 5.7 DNA的三级结构 5.7 DNA的三级结构 （1）正超螺旋： 不利于DNA复制，需要先解旋； （2）负超螺旋： 有利于DNA复制，易被消耗。 5.7 DNA的三级结构 DNA复制时超螺旋的形成 从DNA双螺旋到染色体 5.7 DNA的三级结构 5 核酸化学 5.8 核酸的变性与复性 变性定义：是指核酸受到加热、极端的pH或离子强度降低等因素或特殊的化学试剂（甲酰胺）的作用，其双螺旋区的氢键断裂，变成单链的过程。其中并不涉及共价键断裂。 表征：核酸在变性时，紫外吸收和浮力密度升高，黏度降低，生物活性不变或有利于复制与转录，其中紫外吸收增加的现象称为增色效应。 比较密度大小：RNA、DNA、蛋白质 5.8 核酸的变性与复性 Tm：双链DNA热变性是在很窄的温度内发生的，与晶体在熔点时突然熔化的情形相似，因此DNA也具有“熔点”，用Tm表示。Tm实际是DNA的双螺旋有一半发生热变性时相应的温度。 5.8 核酸的变性与复性 5.8 核酸的变性与复性 DNA的Tm值受到DNA的均一 性、G-C含量、离子强度和特殊的化学试剂的影响。 核酸变性在一定条件下也是可逆的。当各种变性因素不复存在的时候，变性时解开的互补单链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象称为复性。热变性DNA 一般经缓慢冷却后即可复性，此过程被称为退火。 伴随着DNA复性的是其浮力密度和紫外吸收的减少、粘度的增加和生物活性的恢复，其中紫外吸收减少的现象被称为减色效应。 影响DNA复性的因素有温度、离子强度、DNA浓度和DNA序列的复杂度等。 复性 5.8 核酸的变性与复性 19 18 15 5 核酸化学 5.1 核苷酸的结构 5.1 核苷酸的结构 5.1 核苷酸的结构 5.1 核苷酸的结构 绝大多数 少部分RNA有T、DNA有U 5.1 核苷酸的结构 几乎不溶于水，这与其芳香族的杂环结构有关。 互变异构、酸碱解离、紫外吸收。 碱基的性质 5.1 核苷酸的结构 U G A 5.1 核苷酸的结构 核苷是由戊糖和碱基通过β-N糖苷键形成的糖苷。核苷中的戊糖有D-核糖和2-脱氧-D-核糖两种，它们都以呋喃型环状结构存在。前者形成核糖核苷，后者形成脱氧核苷。核苷中的糖苷键由戊糖的异头体C原子（1）与嘧啶碱基的N1或嘌呤碱基N9形成。为了避免碱基环上原子的编号与呋喃糖环上原子编号混淆，在呋喃环上各原子编号的阿拉伯数字后需加“′”。 5.1 核苷酸的结构 嘧啶核苷和嘌呤核苷的化学结构 在核苷中，碱基在糖苷键上的旋转受到空间位阻的限制。结果核苷和核苷酸能以顺式和反式两种构象存在。顺式核苷的碱基与戊糖环在同一个方向，反式核苷的碱基与戊糖环在相反的方向。 由于嘧啶环O2和戊糖环C5′之间的空间位阻，嘧啶核苷通常为反式构象。嘌呤核苷可采取两种构象。自由的嘌呤核苷（特别是鸟苷）更容易形成顺式构象，但是，DNA和RNA螺旋中的嘌呤核苷主要为反式构象。 5.1 核苷酸的结构 核苷酸是核苷的戊糖羟基的磷酸酯。核糖核苷的磷酸酯为核糖核苷酸，脱氧核苷的磷酸酯为脱氧核苷酸。理论上，核苷的5′-OH、3′-OH和2′-OH均可以被磷酸化而分别形成核苷-5′-磷酸、核苷-3′-磷酸和核苷-2′-磷酸。但是，自然界的核苷酸多为核苷-5′-磷酸。 核苷酸 5.1 核苷酸的结构 常见的核苷单磷酸的化学结构 5.1 核苷酸的结构 5.1 核苷酸的结构 AMP、ADP和ATP 核苷单磷酸（NMP）是指核苷的单磷酸酯。核