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第六章经验力场模型—分子力学
第六章 经验力场模型—分子力学
§6.1 引言
• ab initio方法— 精确计算分子的电子性质,计
算量大,对大分子无法计算;
• 半经验方法— 通过近似,可以用于较大的有
机分子,但对更大的如生物分子来说还是不
适用;
• 分子力学— 用来研究大分子体系的性质。
《量子化学与分子力学/分子模拟》
Nankai University 第六章经验力场模型
分子力学模型 Molecular Mechanics(MM)
分子由原子组成,因此孤立分子或相互作用
体系的势能是原子坐标的函数,采用Newton方程
表示(解析式) ,不使用波函数或电子密度。因此
分子力学可获得分子的平衡结构、振动光谱、热
力学性质等,但不能求得体系与电子结构有关的
性质。
经验力场计算的结果有时与最高级别量子力
学计算的结果同样精确,而所耗计算机的时间很
少,因此广泛用于分子动力学等模拟方法。
《量子化学与分子力学/分子模拟》
Nankai University 第六章经验力场模型
§6.2 势函数形式
分子力学中势能面是用解析经验势函数来
描述的,体系的势函数可以分解成多种势函数
的共同作用。通常分为键伸缩能Es 、键弯曲能
Eb 、二面角扭曲能Etor 、范德华作用能Evdw和静
电作用能Eelec等:
E =E +E +E +E +E
total s b tor vdw elec
《量子化学与分子力学/分子模拟》
Nankai University 第六章经验力场模型
键伸缩 键弯曲 键扭曲
Bond Stretching Angle Bending Torsion(Bond Rotation)
++
--
++
非键作用(静电) 非键作用(范德华力)
No-bonded interactions No-bonded interactions
(electrostatic) (van der Waals)
《量子化学与分子力学/分子模拟》
Nankai University 第六章经验力场模型
一个简单力场的函数形式:
k k V
N i 2 i 2 n
V(r ) (l l ) ( ) (1 cos(n ))
i i ,0 i i ,0
bond 2 angels 2
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