变性梯度凝胶电泳分析亚麻茎秆菌群多样性 - 中国农学通报.pdfVIP

中国农学通报 2016,32(6): 102-105 Chinese Agricultural Science Bulletin 变性梯度凝胶电泳分析亚麻茎秆菌群多样性 1,2 2 2 周晓杭 ，葛菁萍 ，平文祥 1 （病原与免疫实验室牡丹江市医学院基础医学院，黑龙江牡丹江157011； 2 微生物黑龙江省高校重点实验室黑龙江大学生命科学学院，哈尔滨150080） 摘 要：亚麻是中国重要的经济作物，为了提高亚麻原茎脱胶的效率，在利用PCR-DGGE 技术研究亚麻 茎杆上菌群多样性的基础上，对其最优电泳条件进行了优化。结果表明：当使用经胶回收后的样品进行 PCR-DGGE ，电泳时间为200~220 min ，变性凝胶梯度为25%~55% ，固定时间为12~ 15 min ，染色时间为 20 min ，显影时间为5~ 10 min 时，得到电泳和分离效果最好。笔者通过优化DGGE 电泳条件，可以更加 清晰的得到沤麻过程中细菌的多样性，该工作对利用PCR-DGGE 技术研究亚麻茎秆菌群多样性提供了 方法基础。 关键词：变性梯度凝胶电泳；亚麻茎秆；菌群多样性 中图分类号：Q939.99 文献标志码：A 论文编号：cas AnalysisofFlaxStemMicrofloraCommunityDiversitybyDenaturantGradientGelElectrophoresis 1,2 2 2 ZhouXiaohang ,GeJingping,PingWenxiang 1 (LaboratoryofPathogensandImmunityofCollegeofBasicMedicine, MudanjiangMedicalUniversity,MudanjiangHeilongjiang157011; 2KeyLaboratoryofMicrobiologyofHeilongjiangProvince,CollegeofLifeScience,HeilongjiangUniversity,Harbin150080) Abstract: FlaxisanimportanteconomiccropinChina.Inordertoimprovetheefficiencyofretting, the authors used PCR-DGGE technique to study the flax stem microflora diversity, and optimized the best condition ofthismethod.Theresultsshowedthat,whenPCR-DGGEwascarriedoutusingthe gel recycling samples,theelectrophoresistimewas 200-220 min,modifiedgelgradientwas 25%-55%,fixedtimewas about 12-15min,dyeingtimewas20min,developingtimewas5-10min,theelectrophoresisandseparation results were good. The study clearly obtained the bacteria diversity in flax retting by o