短额负蝗线粒体基因组及其lrrna 和srrna 二级结构分析.pdf

动 物 学 研 究 2007，Dec. 28(6) ：580－588 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research 短额负蝗线粒体基因组及其 lrRNA 和 srRNA 二级结构分析 丁方美，师红雯，黄 原* （陕西师范大学生命科学学院，陕西 西安 710062 ） 摘要：采用长距 PCR 扩增及保守引物步移法测定并注释了短额负蝗的线粒体基因组全序列。结果表明，短 额负蝗的线粒体基因组全长 15 558 bp ，A+T 含量为 74.3%，37 个基因位置与飞蝗的一致，基因间隔序列共计 11 处 64bp ，间隔长度从 1～16bp 不等；有 15 对基因间存在 51bp 重叠，重叠碱基数在1～8bp 之间。13 个蛋白质编 码基因中找到 6 种可能的起始密码子，有 12 个基因在基因 3 ＇端能找到完全的 TAA 或 TAG 终止密码子，只有 ND5 基因终止密码子为不完整的 TA 。除tRNASer （AGN ）外，其余21 个 tRNA 基因的二级结构均属典型的三叶 草结构。tRNASer （AGN ）的DHU 臂缺失，在相应的位置上只形成一个环。预测的 lrRNA 二级结构总共有 6 个结 构域（结构域Ⅲ缺失），49 个茎环结构。预测的 srRNA 的二级结构包含 3 个结构域，33 个茎环结构。A+T 丰富 区中存在一个被认为与复制及转录起始有关的 Ploy （T ）（T-stretch ）结构。 关键词：线粒体基因组；rRNA 二级结构；短额负蝗；锥头蝗科；直翅目 中图分类号：Q969.26 ；Q754 文献标识码：A 文章编号：0254-5853-(2007)06-0580-09 Complete Mitochondrial Genome and Secondary Structures of lrRNA and srRNA of Atractomorpha sinensis (Orthoptera, Pyrgomorphidae) DING Fang-mei, SHI Hong-wen, HUANG Yuan (College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi’an 710062, China) Abstract: The complete sequence of Atractomorpha sinensis mitochondrial genome was determined using long PCR and conserved primer walking approaches. The results showed that the entire mitochondrial genome of A. sinensis is 15558bp long with A+T content 74.3%. All 37 genes are conserved in the position observed in that of Locusta migratoria . Genes are closely assembled one after the other, leaving a total of 64 bp (excluding the A+T rich region) in intergenic spacers, ranging in size from 1 bp to 16 bp. The extremities of some genes overlap with each other b