数据库原理与程序设计（孙杰）实验四：数据库的构建.docVIP

下载本文档

2
0
约小于1千字
约 10页
2017-07-16 发布于浙江
举报
版权申诉

数据库原理与程序设计（孙杰）实验四：数据库的构建.doc

1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

年级 09 专业生物技术课程名称数据库姓名王心宇学号 2009156047 实验日期 2011.12.15 实验题目实验四：数据库的构建实验目的掌握数据库设计的周期实验要求数据库中存放着基因的geneid，基因名；数据库中存放着蛋白质复合物的名称和蛋白质复合物的ID；数据库中存放着基因和基因之间的互作关系数据，在基因互作关系中，用geneid代表基因；数据库中存放着蛋白质复合物和组成蛋白质复合物的基因；原始数据：基因互作数据，蛋白质复合物数据，基因信息数据；给出一个基因的名称或者基因的ID，查询该基因相关的蛋白质复合物；给出一个基因名或基因的ID，查询该基因在基因互相网络中的直接互作基因；给出一个蛋白质复合物的名字或复合物的ID，查询构成该复合物的基因，以及该复合物的相关基因之间的互作关系；我们所关注的所有基因，蛋白，复合物都是人类的；构建适当的数据库和数据表，实现上述数据的存放和相应查询要求；实验步骤去掉HPRD_ID_MAPPINGS.txt中的第一行。然后导入symbol,geneid,swissprot_id。 (下面为导入gene.txt得到的，因为allComplexesCore.csv中subunits (Entrez IDs) 存在问题。所以不采用下面这个表) 去掉allComplexesCore.csv第一行，然后导入id和name 去掉BINARY_PROTEIN_PROTEIN_INTERACTIONS.txt第一行，导入gene1，gene2，reference_id（complex_id）；去掉allComplexesCore.csv第一行，然后导入id, subunits (UniProt IDs) 基因互作数据:表 pro_interactors; 蛋白质复合物数据:表pro_complex 和pro_subunits; 基因信息数据:表gene_info 给出一个基因的id‘9759’，查询该基因相关的蛋白质复合物给出一个基因的id‘43’，该基因在基因互相网络中的直接互作基因给出一个蛋白质复合物的名字或复合物的ID‘333’，查询构成该复合物的基因，以及该复合物的相关基因之间的互作关系实验步骤实验步骤实验步骤实验步骤总结附录