PBS简要使用说明.pdf

PBS 作业调度系统简要使用说明 提交作业 以test01 用户登录到lxcn01..04 任一节点,并ssh 到lx0110 上 使用qsub 命令行提交作业 下面是418 号作业的输出 使用脚本提交作业 脚本内容如下： 提交作业及查看作业状态（要查看列详尽作业相关请执行 qstat -f job_id ）： 下面的为419 号作业标准输出部分截图 作业提交脚本编写参考 其实质是shell 脚本，只不过添加了一些PBS 参数或设定而已 常用的PBS 选项有： 选项 描述参考 #PBS -N myJob 指定作业名，默认为脚本名 #PBS -l 指定作业资源，此处为四个节点每个节点２个 nodes=4:ppn=2 虚拟处理器 #PBS -q queuename 绑定作业队列 #PBS -l 每个作业运行时能使用的最大wall-clock time walltime=01:00:00 #PBS -o 指定作业标准输出文档及路径 mypath/my.out #PBS -e 指定作业标准错误输文档及路径 mypath/my.err #PBS -j oe 标准输出与标准错误输出合流 #PBS -W 在作业开始前把file_list 复制到计算节点 stagein=file_list #PBS -W 在作业完成后把file_list 复制到计算节点 stageout=file_list #PBS -m b 在作业开始时给用户发送邮件 #PBS -m e 在作业结束时给用户发送邮件 #PBS -m a 在作业中断时给用户发送邮件 允许用户对在同一行上带有相同标志的命令 #PBS -m ba 进行分组，否则只有最后一个命令被 执行 #PBS -r n 指定在作业执行失败后不再重试 #PBS -V 导入所有环境变量 这里要特别说明一下是的 #PBS -l，其格式与 qsub -l 是一样的，下面举例说明 ex1: qsub -l nodes=5 等价于脚本中的 #PBS -l nodes=5, 表示使用集群中任意五个节点来执行该作业 ex2: qsub -l nodes=2:server+14 等价于脚本中的 #PBS -l nodes=2:server+14, 表示使用集群中的两个 server 节点 与另外十四个节点来执行该作业 ex3: qsub -l nodes=4:ppn=2 等价于脚本中的 #PBS -l nodes=4:ppn=2， 表示该作业需要四个节点且每个节点 都有两个虚拟处理器空闲 ex4: qsub -l nodes=lx0111:ppn=4+lx0112:ppn=2 等价于脚本中的 #PBS -l nodes=lx0111:ppn=4+lx0112:ppn=2， 表示该作业需要 lx0111 上的四个空闲处理器与lx0112 上的两个空闲处理器来共同完成